大陆与台湾经贸关系可以从贸易与投资两个方面考察。在双边贸易方面，大陆对台湾长期以来一直存在着高额逆差；在直接投资方面，投资与贸易逆差的变化呈现明显的趋同性。大陆对台湾的贸易逆差主要经历了顺差――小幅逆差――逆差快速增长――逆差增长趋缓的时期，截止到2002年底，大陆对台湾贸易逆差累计已达1826.77亿美元，呈现出两个方面的特征。
一是出现逆差的产品相对集中
大陆对台湾的商品贸易涉及很多领域，但就台湾对大陆的出口商品结构看，有四大类产品，即机电类产品、塑料橡胶制品、纺织及其制品以及贱金属及其制品，是台湾对大陆顺差较大的，尤其是机电类产品，逆差存在不断扩大的趋势，这四类商品的逆差额在历年大陆对台湾贸易逆差总额中的比重大约为90%。大陆对台湾顺差较明显的商品是初级产品，这样的进出口商品结构反映了大陆与台湾两地产业结构的差异以及比较优势的不同，也说明大陆仍然没有摆脱以初级产品出口为主的贸易格局。
二是出现逆差的地区比较集中
从大陆对台湾商品贸易的地区分布看，广东省、江苏省、福建省和上海市这四个沿海省市是大陆对台湾贸易的集中地，同时也是出现对台贸易逆差的集中地，四省市对台的贸易逆差额占大陆对台贸易逆差总额的89.8%，其中仅广东一省就占到60.86%，是大陆对台贸易逆差的最大来源地，其余两省一市的比重分别为11.6%、9.5%和7.87%。因此，地缘性和区域发展不平衡性是大陆对台湾逆差的一个突出特点。
出现这样的区域分布状况与台湾对大陆投资的地区分布是分不开的。根据台湾的统计数据，1991～2001年的11年间，台湾对广东、江苏的投资占对大陆投资总额的比重分别高达34.31%和36.77%，合计占71%。投资对贸易的带动作用在这里表现的非常明显。其实从整体来看，台湾对大陆直接投资与对大陆商品贸易的关系十分紧密，在长期趋势上，对大陆投资的增加一直伴随着与大陆商品贸易逆差的增加，比如1993年，台湾对大陆的直接投资增长199%……同期，大陆对台湾的贸易逆差也增加122%。截止2002年底，大陆的台资企业数为55691家……合同台资金额614.7亿美元，实际投资资金331.1亿美元，台湾已经成为大陆吸引外资的第五大来源地。这反映出台湾对大陆投资的主要目的之一是扩大对大陆的出口。
大陆对台湾的长期高额逆差与台湾当局的限制性大陆经贸政策有很大的关系。在两岸的经贸往来中，台湾当局一直实行“严进宽出”的贸易政策，对从大陆进口的商品实行严格的管制……而在大陆方面，却对台湾采取积极的开放经贸政策，鼓励与台湾的贸易和从台湾进口商品……这种开放的单向性势必导致大陆对台湾贸易逆差。导致大陆对台湾贸易逆差的另外一个因素是两地产业分工与合作格局。由于经济发展水平的差异，大陆与台湾在经济结构、产业结构以及生产技术水平等方面都存在着差别。台湾已于20世纪80年代顺利完成了劳动密集型向资金和技术密集型的转变，并于90年代实现了向高科技领域的发展，从而形成以服务业和高科技产业为主导的经济结构。而这一系列的转变，都是在台资大规模向海外转移，尤其是向大陆转移的过程中实现的。由于将传统产业和一些高科技产业转移到大陆，台湾与大陆之间形成了垂直分工与水平分工并存的产业分工与合作格局，台湾以其研发水平和中高端产品制造和上游原料及零部件生产的比较优势而在这一格局中属中上游环节，大陆则承担低端生产环节。
由于一些主要国家，如美国，一直是台湾的第一大出口市场，其对美国的贸易依存度高达40%以上，且呈顺差，为了缓解与美国的矛盾，台湾调整产业结构，将劳动密集型生产向大陆转移，将直接向美国出口转为通过大陆间接出口，同时将与美国的直接矛盾和摩擦也转移给大陆。大陆与台湾的贸易逆差为大陆经济带来了诸多不利影响。
为了积极平衡逆差，一方面要利用WTO的有关规则促使台湾当局开放市场，加强与台湾在科技、服务和营销等领域的广泛合作，另外一方面要努力提高大陆产品的质量和附加值，提升产品结构，推动两岸贸易形式由加工贸易向新型贸易模式转变。
3.港台与大陆经贸关系的进一步发展
（1）大陆与台湾的经贸关系变化
在中国内地成功加入WTO后不久，台湾也以单独关税区的名义同时入世，这一“我先台后”的入世模式没有改变大陆与台湾的地位和相互关系。入世后，海峡两岸都将按照WTO的基本规则来处理两岸经贸关系，主要产生于台湾方面的经贸合作障碍有望得到缓解。
①“间接”变“直接”。迄今为止，由于台湾方面以“安全”为借口而对两岸经贸往来施加限制，导致大陆与台湾的经贸大多要通过香港、澳门等第三方进行，这不仅加大了运输成本，拖延了时间，而且对两岸经贸产生许多不利的影响。尤其对台湾方面，因为台湾出口大陆的商品量远远大于大陆出口台湾的商品量，因而给台湾带来的麻烦更多，不利影响更大。
虽然WTO并未明确规定两岸之间必须通航，但对于台湾和大陆，都应该正确认识这一点，一定要突破传统观念与思维，如果两岸不能通航，又谈何通商！如果两岸不能通航，又谈何“低成本”！如果两岸不能通航，又谈何经贸发展！因此，两地都必须深刻而正确地认识到通航对双方的重要性，尽快解决两岸相通的问题，只有这样，台湾的经济利益才能够充分实现；只有这样，大陆与台湾的经贸往来才能更加便利和通畅；也只有这样，两岸才能同时实现经济的共同发展。
②“单向”变“双向”。既然都已经是WTO的正式成员，那么就都应该按照WTO的规则办事。WTO的基本规则包括：第一，非歧视的。指不允许对来自贸易对方的货物和企业实行歧视性待遇，以最惠国待遇原则和国民待遇原则为体现。第二，透明度原则。
即成员国的贸易政策必须公开和透明，必须能够被其他成员国了解和掌握。第三，互惠原则。
即成员国之间通过互惠条件的彼此给予而进入对方的市场。第四，公平竞争原则。不平等竞争是WTO禁止的。而从目前两地的经贸发展来看，台湾对大陆的限制显然大大多于大陆对台湾的限制，即具有单向性，大陆不能进入台湾，而台湾却能够进入大陆市场，这与WTO的根本原则是严重背离的。这一单向性对于大陆和台湾都极为不利。对于大陆，不利于逆差的改变，不利于具有发展潜力的企业进一步发展。对于台湾，不利于成本的降低……不利于经济推动力的培养和发育。
因此，大陆与台湾经贸往来中的单向性必须得以扭转，至少应该在WTO“公平竞争”的原则基础上实现双向性。
无论如何，两岸合作的大势不可逆转也不可阻挡。WTO所构建的框架必将促使大陆与台湾在贸易领域的合作继续扩大的同时，两岸的投资、技术及服务贸易领域的合作进一步加强，两岸的金融交流与合作将逐步放开，两岸的经贸往来前景广阔。
（2）大陆与香港经贸关系的发展
香港长期以来充当着中国内地对外贸易的中转站，为大陆运输、服务和旅游业的发展起到恶劣极大的促进作用。入世后，两地转口贸易的发展不会立即改变而会继续增加。在此基础上……大陆政策会进一步调整和改善，政策的透明度和稳定性都将提高，大陆的贸易与投资条件会得到改进，为两地经贸关系向更深层次发展奠定更加稳固的基础。
入世后，香港会面临角色的转变，将从转口港转变为制造业中心，进而转变为国际商业中心……这一系列的转变会使香港在投资方向、投资区域等方面都更加多元化，其人缘、地理和文化优势，以及畅通的渠道、丰富的经验和良好的适应性，都将成为大陆引进外资、对外合作的有利的中介和合作伙伴，香港的资金、信息、渠道等优势与大陆资源、市场等优势将会更加紧密地结合而转化为推动两地经济发展和加强合作的主要动力。
