小麦的清理流程并无一定的标准，不过，通常在流程中包括以下几点：
（1）清理较小麦大或小的尘芥杂质和部分粮谷杂质。
（2）精选出荞子、野草种子和大麦、燕麦。
（3）利用风选清除轻杂及尘土。
（4）利用打麦和刷麦，清理小麦表面。
（5）利用磁选清除金属杂质。
（6）洗麦以及水分调节，如不用洗麦机，则单独使用水分调节设备。
（7）利用比重不同清除石子。
（8）在小麦清理流程中，除用上述设备以外，还采用喂料设备，以保证入机小麦流量均匀；采用配麦设备，使不同品质的小麦按比例搭配；采用吸风除尘系统，保证车间环境卫生，并根据生产需要，配置一定容量的麦仓。
