蒋介石就任总司令以后，任命了总政治部主任周恩来（未到职），后改为邓演达。又任命邵元冲为总代表———总之，蒋介石的手法是用一个右派看住一个左派，再用一个左派来限制右派。蒋先云被任命为总政治部参谋处副处长。
蒋介石正在司令部专心研究军事地图。
“我正在城楼观山景，耳听得城外乱纷纷。旌旗招展空翻影，却原来是司马发来的兵。”蒋介石轻声唱着，翻动着那幅好像洋铁皮一般瑟瑟发响的地图。这是苏联顾问精心绘制的。蒋介石用红蓝铅笔修改过，他特别把倾向直系的各部队图形外面加了一道框，又把“红胡子”活动地区点成了麻子坑。他自己的号称二十万人马画成了好几个很大的鲜红的椭圆形，它们前面的箭头直指向敌人。这对被召集到这里来的指挥员们说，是有很大的心理影响的。
“你们看，”蒋介石常常指着地图说，“我们的力量怎么样，吴佩孚他们又怎么样！我是一正压三邪！”
指挥员们播着后脑勺，不明白他说的是什么意思。
“我的‘介’字是个正人字，底下还有两根支柱，那就是国民党和共产党。张作霖的‘作’字，吴佩率的‘佩’字，孙传芳的‘传’字，都是一个邪人字，这是气数注定，非人力所能挽救也！”
指挥员们被蒋介石的奇特解释，惊得目瞪口呆。
站在窗边的蒋先云，小心地注视着蒋介石的一举一动。在他光闪闪的黑眼睛里，显示着某种担忧的复杂情感。手枪走火事件和继续留在蒋介石身边工作，使他有了很大的精神压力。他在共产党人中有些孤立。尽管他文武双全，在当时的情况下，他不能完全识破蒋介石也是合情合理的。所以他对蒋介石说的话也是开诚布公：“校长，我不希望共产党人和国民党人分道扬镳。”
“正是这样！”指挥员们走了以后，蒋介石坐下，和蒋先云谈起来。“所以，上次事件（指中山舰事件）处置非常，事前未及报告，专擅之罪诚不敢辞，应自请从严处分。我要杀共产党人等于自杀！”
蒋先云有些惊异，问：“校长对我有什么指示？”
“此次北伐，你继续留在我身边，当我的侍从参谋。”
“北伐胜利后，我想离开。”
“不要离开，你是我的好学生，我会重用你。你以后可以到军校当中将教育长。”蒋介石很少会将自己的安排说得这样详细，他肯定是经过一番认真考虑的。“我知道你有委屈（蒋先云曾因手枪走火，险些伤人受到共产党内处分），你是共产党员，又受了留党察看的处分。其实你完全可以解脱，脱离C。P。组织。”
蒋先云警惕起来，用固执的目光瞪着蒋介石：“这不行。别的可以牺牲，但共产党籍不能牺牲。”
“我不勉强你。只要你在我身边就行。其实，我对你们共产党的才能也是十分敬佩的。”蒋介石摩挲着头顶，回忆着说，“我们党要是有个周恩来，肯定会无往而不胜，可我发现他心神不定，和我的关系渐渐疏远，他和我还是同乡嘛。加伦将军我也很佩服，他能让那些一辈子没有动窝的将领亲自到前线去。谭延就是这么一位。可是只要加伦说一声，谭延应该到前线去，老头子就立刻出发了。”
蒋介石很少有这样开心议论别人的时候。
“你要以你的威信去游说共产党的领导人。”蒋介石敛起笑容，从抽屉里拿出一份文稿，递给蒋先云，“当然，我也要影响他们。这份文告你看看，如无疑问，请即日发布出去。”
下面是这篇文告的全文：
（蒋）校长留别全体官长学生书
本校全体官长学生各同志钧鉴：本校长受党与政府之委托，督师北伐，所倦倦不能忘者，以我全校官长学生为最。临别赠言，血诚所寄。凡我同志，幸各谛听。革命成功之最大要素，为团结精神，统一意志，集合一切革命势力。是故本校校训，为亲爱精诚。本党使命为谋全民革命，而必植基于农夫、工人，且与共产党合作。我全体官长学生，宜相亲相爱，宜团结一致，宜共同集合于革命旗帜之下，努力工作。共产党同志不得怀疑批评三民主义，国民党同志亦不得稍有排斥共产党同志态度。本校长向以革命为前提，前次提出整理党务案，及要求我同学各保持纯粹之党籍，皆仅考虑本党与共产党合作之方法，并非怀疑本党与共产党合作之原则。无论其退出C。P，而为纯粹之国民党员，或退出国民党而为纯粹之C。P。分子，本校长皆一视同仁，无分畛域。各同学亦切勿稍有歧视。既为同学，又同致力于革命，即宜互相亲爱，共泯猜疑。彼反革命者，以讨赤为名，不独仇视C。P。，凡国民党稍努力之同志，即概诬为C。P。，或加以卖党之罪。此种态度，我同学不宜效之，其秘密之小组织，与任何小团体，皆宜悬为厉禁，视为亲爱精诚之大敌。近来部队中有仇视政治工作人员者，即为陷入反革命之渐。各官长宜于暇时研究政治经济，各学生亦十分重视政治教育，方不负本校军事政治并重之旨，且可充分明了主义，成为真正革命军人。至服从命令，信守纪律，尤为军人必守之天经地义。本校长出征以后，校长职务，已委任方教育长代拆代行。各官长学生务一致服从方教育长之命令，与服从本校长之命令无异。黄埔今日已为革命之中心，一方为全国人民所瞩望，一方为帝国主义者所嫉视。惟有以大无畏之精神，百折不挠之志气，辅以谨慎戒惧之心理，廉洁高尚之美风，确信革命系为劳苦群众谋解放，而非为个人争功名富贵。故大群之团结必须坚固，小己之自由独立，皆在于是。前方之胜利，悉系于后方之巩固，而本校尤为革命之根本，我全体官长学生其共勉之。中正敬启，（民国）十五年七月二十七日。
不久，蒋介石率师出征。
在广州车站，蒋介石乘坐的那节花车已挂在列车上。蒋介石带着十岁的蒋纬国，在车前和送行的人们照相。张静江坐在轮椅上，围着张静江站立的有吴稚晖、鲍罗廷和蒋氏夫妇。当时天气正值酷暑，陈洁如穿了一身带花的旗袍，双袖及肘，露出修长的手臂。（台湾新闻局出版的《蒋总统画报》曾刊出这张照片，可是照片上的陈洁如已经消失，仅剩下半个袖子。）
