新鲜的动物骨头含有大量的水分，往往还带有未剔净的残肉，这为微生物的侵入和大量繁殖创造了良好的条件。因此，动物鲜骨在剔取肉后，若不能及时加工利用，应采取适当方法加以保藏。如堆放在空气流通、干燥、卫生的阴凉处。但在夏秋季，保藏时间不能超过24小时。
对于非新鲜、未变质的动物骨头来说，也应放在温度较低、干燥、清洁的地方加以保管。如骨堆下面应垫一竹席，四周围上塑料薄膜，并应采取防潮措施。
生产食用畜骨产品，最好将动物骨头存放在0℃～5℃、相对湿度80％ 左右的冷库中。
无论是新鲜骨或非新鲜骨，保藏方法不当，如堆放在潮湿和不通风的场所，且长时间遭到日光直接照射或蚊蝇叮咬，就会明显降低骨头的品质，甚至变成废品。因此，要注意动物骨的合理保藏。
