南美母驼的发情特征表现很不明显。母驼发情时通常卧地,等待公驼交配,其交配方式与单峰驼和双峰驼相似,求偶过程非常短暂,基本都用不到一分钟。如果母驼未发情,则会表现出拒配。如果有发情母驼交配,则驼群中其他发情母驼会走到交配的骆驼旁,卧地等待公驼交配。发情旺盛的母驼也常常爬跨其他母驼。
与双峰驼和单峰驼一样,南美母驼如果发情后没有交配,则也会长时间表现发情,发情的时间有时可长达36天,但是在这一过程中,至多会有1~2天的拒配期。