人类基因组计划工程重大而复杂，完成整个计划所需的经费堪称天文数字，仅按每个碱基1美元计算，美国就要投入30亿美元。因此，用纳税人的30亿美元搞“人类基因组计划”这一庞大计划，最初在美国争论得相当激烈。
后来美国政府对此做了不少工作。他们印了很多内容浅显的小册子，如《人类基因组有多大》、《了解我们的基因》等，说明“人类基因组计划”的必要性，并解释为什么要花这么多钱，这钱花得有多值。每份小册子都讲得通俗易懂、活灵活现。
比如在有的小册子中，科学家比喻人的基因组就像地球那么大，一个染色体就像一个国家那么大，一个基因就像我们所住的楼那么大。搞清楚30亿对核苷酸，就好像搞清楚整个地球上的30亿人各姓什么。而所谓的“制图”，就像在高速公路上标路标……
“人类基因组计划”被民众接受的过程，也就是社会学家、伦理学家、生物学家进行的一场有关基因的科学普及过程。
科学家认为，“人类基因组计划”揭示出的人类最终奥秘，势必冲击社会、法律和伦理，因此必须让广大民众有心理准备。
“人类基因组计划”的形成，曾几度彷徨，几度反复，但最后，人类还是选择了它。
“人类基因组计划”之所以重要，一方面是因为人的一切都和基因问题有关。不仅疾病与基因有关，人的出生、成长、衰老和死亡也都与基因有关，或者更具体地说，都与DNA的序列有关。另一方面，正如杜伯克所说的，既然大家都知道基因的重要性，那我们只有两种选择，一是“零敲碎打”，大家都去“个体作业”，去研究自己喜欢的、认为是重要的基因；而另一种前所未有的选择，则是从整体上搞清人类的整个基因组，集中力量认识人类的所有基因。
那么究竟是“零敲碎打”的效率高，更能对人类的健康作出贡献呢，还是“集中力量攻破”的作用大呢？在教训和经验面前，答案已经是不言而喻的了。
可是，“人类基因组计划”雄心太大、规模太大，要花的钱也太多，因此有很多反对意见。
比如，有人就认为用纳税人的30亿美元搞庞大无比的基因组序列，是拿纳税人的钱开玩笑；到2005年完成这个计划是吹牛（说实在的，能否如期完成，谁心里也没底。而且制定计划的时候，连现代化的测序仪都没有）；自然科学要研究的问题有很多，为什么先上这个计划？这笔钱花到别的地方也许更值、更实际，而这个计划目标过多、预算过大，得到的东西也只不过是“一张部件名单”；“制图”是在沙漠里建公路，“测序”是把“垃圾”分类；即使搞基因组计划，也应该先搞小的，如细菌、果蝇等，或经济意义大的，像小麦、猪、羊等。有人讥笑研究人的基因组是“泥足巨人”，预测它最终会像1975年开始的肿瘤计划一样流产。
1990年，美国刚搞“人类基因组计划”时，好多人联名写信表示反对，结果原来的预算被砍了3400万美元，原计划成立的9个中心被砍得只剩下3个，每个中心的经费也从400万美元减到200万美元。
而且，“人类基因组计划”并不是当时独一无二的计划，有很多对手都在同它争夺科学家和研究经费。
20世纪80年代初，由于生物技术，特别是遗传工程等技术的进展。生物学、医学的研究酝酿着新突破。大批肿瘤基因与肿瘤抑制基因的发现，使70年代趋于彷徨的肿瘤研究“柳暗花明又一村”；在生物学领域，基因克隆技术被攻克，遗传表达研究技术渐趋完善，“讯号传导”研究初露曙光，神经活动的研究似乎也面临突破；大规模双向电泳、核磁共振等技术的建立与改进，使蛋白质研究方兴未艾……上述每一方面都有理由提出一个“计划”，如“肿瘤计划”、“遗传工程计划”、“讯号传导计划”。这些计划都无可非议，也确实已经有人提出来过，但最终只有“人类基因组计划”被大家接受了，并最后成为国际性重大计划。
这是为什么呢？因为所有这些计划的最关键因素，都需要基因来操作！从某种意义上讲，“人类基因组计划”是一个“补课计划”。只有了解人类的整个基因组，实施其他计划才有可能。
人类基因组那么庞大，那么复杂，为什么不先从简单物种或更有经济意义的动植物入手呢？
让科学家来回答这个问题吧。
首先，世上万物人为首，人最重要，整个社会对人最为关切。
其次，没有变异就没有基因的发现，人类在上万年的与疾病斗争的过程中，对人类本身的众多疾病与遗传变异有了较大的积累，也为研究自身提供了最珍贵的材料。
再次，人类基因组的研究进展，可以直接、迅速地用于解决其他生物基因组的问题，揭示生命现象的本质。
“国际人类基因组计划”还将推动生物高新技术的发展，产生重大的经济效益，特别是应用于人的基因产品，如果能作为药物使用，不仅可改善人的健康状况，经济前景也不可限量。
1986年杜伯克在他的“标书”里写道：“这一计划的意义，可以与征服宇宙的计划媲美。我们也应该以征服宇宙的气魄来进行这一计划。”“这样的工作是任何一个实验室都难以承担的。它应该成为国家级的计划，并使它成为国际性的计划”。
14年后，当人们庆贺“人类基因组计划”进展顺利时，不能不钦佩杜伯克的高瞻远瞩，也不难理解“标书”为什么能在全世界引起那么大的反响。
“人类基因组计划”的目标，讨论来讨论去，数易其稿，最终对每一部分都有了具体目标，并要求定质、定量、定时完成。
谁不想了解自己的基因呢？如果没有特殊的外因影响，我们的基因在出生以后变化不大。我们要特别了解：1我们的基因在我们家系中的传递规律，照料好我们的后代；2我们要了解“病与不病”的原因，以及基因与环境作用的结果，照料好自己的基因。人类基因组计划能够坚持到今天，全靠如同我们这样的广大民众的支持。因为这是一项公益性的计划，关系到千家万户，千秋万代。而现在，不同意见几乎没有了。
德国于1995年才开始“德国人类基因计划”，德国科学家反省到：一个科学的设想，如果等到已经没有一个人反对的时候才执行，即使正确也肯定为时已晚。德国在二战后曾错过两个科学发展的机遇：一是电子计算机，另一个就是人类基因组计划。
英国的国际人类基因组计划于1989年2月开始，特点为全国协调，资源集中。“英国人类基因组资源中心”一直向全国的有关实验室免费提供技术及实验材料。自1993年开始，伦敦的桑格中心成为全世界最大的基因测序中心，单独完成1／3的测序任务。
法国的“国家人类基因组计划”于1990年6月启动，由科学研究部委托国家医学科学院制定。诺贝尔奖金获得者道赛特用自己的奖金于1983年底建立了人类多态性研究中心（CEPH）。法国民众给了这项研究有力的支持，他们至少捐助了5000万美元。CEPH与相关机构为人类基因组研究，特别是第一代物理图与遗传图的构建，作出了不可磨灭的贡献。
法国对人类基因组序列图的贡献，也由此达到了3％左右。
日本的“国家级人类基因组计划”是在美国的推动下，于1990年开始的。与日本在其他领域的领先地位相比，它的人类基因组研究可就要略逊一筹了。但这几年的进展却很快。
日本对DNA序列图的贡献为7％。
此外，加拿大、丹麦、以色列、瑞典、芬兰、挪威、澳大利亚、新加坡、俄罗斯国家，也都开始了不同规模、各有特色的人类基因组研究。
由于科学家的呼吁，我国的“人类基因组计划”于1993年开始。这一计划的第一阶段，得到了国家自然科学基金委员会的资助。在这个项目中，有著名遗传学家组成的顾问委员会，有中青年科学家组成的学术专家委员会，还有“中国人基因组多样性委员会”和“社会、法律、伦理委员会”。此外还有一个小小的秘书处，负责国际联系、国内协调与日常事务。
