南北战争期间，马什和柯普一样到了欧洲留学。在获取知识的同时，马什也利用皮博迪侄子的身份四处活动，终于在皮博迪最后一项重大捐赠的名单中列入了耶鲁大学。
在1865年他回国前，不仅让皮博迪答应永远拨给他充足的学费、考察费，更出资15万美元为耶鲁大学盖一座自然史博物馆。
这一切都在马什的计划之中，大喜过望的耶鲁校董、校长感到无以为报，一方面把博物馆命名为皮博迪自然史博物馆，一方面盛情邀请马什留校，任博物馆馆长。
皮博迪赢得了不少掌声和颂词，马什却为自己搞到了实实在在的好处，他打通了校方的铁杆儿人脉、拥有了响亮的教授头衔、获得了滚滚而来的研究经费和宽敞气派的研究室。
1866年，马什被耶鲁大学聘任为北美的第一位古生物学教授，那年他35岁。
那么柯普呢？对于柯普来说，宁静的欧洲可能比战争还要折磨人，而且他念念不忘数年前他的老师雷迪找到的那种“袋鼠模样”的糙牙龙和鸭嘴龙，所以他非常渴望能早点回到美国去大干一场。
终于，到了1864年，柯普完成学业后得以回国，很快就被费城附近的哈弗福德学院聘为动物学教授，次年又被委任为史密森自然史博物馆的馆长。但以柯普的战斗热情，并不适合学院的工作。他便三天两头地往发现过鸭嘴龙的哈登菲尔德跑，1866年还在那里买了间房子。可以预料，他在学院的教学工作屡屡无法按时完成。院方对此非常不满意，柯普更是厌恶那种案牍劳形的职业。
1868年，他干脆就炒了学院鱿鱼，甚至连父亲给他的农场都变卖了，一门心思投入到哈登菲尔德的发掘工作中去。
天道酬勤！1866年夏，柯普在新泽西州的巴内斯波罗镇附近的一个矿坑发现了一块76厘米左右的鸭嘴龙股骨，这是他亲自发现的第一块化石。没过多久，在秋天到来之前，这里便发现了一具前所未见过的恐龙化石，化石包括颚骨碎片、肢骨、指骨和爪。其中令他狂喜不已的是一只长达20厘米的巨爪，就如同鹰爪那样尖锐！
柯普当时写给他父亲的一封信中这样描述：“……我发现的遗骸比我预想的要有意思得多。它们可能是属于巴克兰的巨齿龙类中一种全新类型的巨型肉食性恐龙，就是它们毁灭了雷迪的鸭嘴龙。它们是用爪捕食的，保存下来的有一只爪或爪关节，至少有20厘米长。爪子的形状介于鹰爪和狮爪之间……”
