卜者预言产生了席卷人间一切活动的厌倦情绪，查拉图斯特拉也未能幸免，因为他也经常受到虚无主义的袭击，成为自己学说的背叛者，因而他对自己大为不满并深感不安。
《查拉图斯特拉如是说》第三部分的基本情节是：
查拉图斯特拉决定走向最危险但又最伟大的旅程，他决心走向最后的孤独，走向没有追随者的顶点。他在一艘船上向水手们诉说了他作为最孤独者的一个幻象。这个幻象中，侏儒嘲弄似的对他说，你确实是智慧之石，“啊，查拉图斯特拉，你被断定被自己的石块所击毙：你把石块抛掷得很远——但是它会坠落在你自己的头上！”查拉图斯特拉进行反击：“但是我身上有一种东西，名为勇敢，勇敢能消灭痛苦、恐惧、怜悯、死亡等。”侏儒被驱走了。这个幻象喻示查拉图斯特拉要彻底消灭侏儒，成为一个前所未有的巨人。他又振作起来，继续他的思考和布道。
《查拉图斯特拉如是说》的第四部分，是借一个结构完整的故事来表达他的思想。故事的大意是：
经过许多岁月，查拉图斯特拉的头发渐渐白了。这天，他满怀激情和自己的鹰、蛇叙说自己的渴望与信心，听到山洞外面一阵阵呼唤，于是他下山寻找这些声音。路上，他首先遇到的是两个国王和一头驴，国王不愿生活在子臣们的钻营与谄媚之中，于是决定放弃王座；第二次遇到了水蛭专家，这是一个科学家，他毕生致力于研究水蛭脑部的构造，其他什么也不知道；第三次遇到了巫师，他原来以各种手段欺骗大家，但就是不骗自己，在查拉图斯特拉面前他感到疲倦，讨厌自己的装假和巫术；第四次遇到了教皇，他虔诚地回忆着神职人员纷纷退职，因为上帝已经死了；第五次遇到了最丑陋的人，这是个杀死上帝的凶手；第六次遇到的是乞丐，由于自羞于他的财富，想逃到牛群中，学习牛的反刍；第七次遇到了预言者，自言自语：“什么都是一样，没有任何东西是有价值的，世界毫无意义。”查拉图斯特拉晚上回到洞府，发现白天遇到的人都聚集在那里——预言家、乞丐、最丑陋的人、教皇、巫师、水蛭专家、两个国王和一头驴。这些人都脱离人群，对人类所感到的真正的痛苦茫然无知，只是在那里创造一个个无关痛痒的是非；这些人早先依赖上帝，现在上帝死了，他们的思想、言行也就失去了依据，便在不知不觉中找到一个笨伯作为代替。当查拉图斯特拉离开洞穴片刻返回之后，发现这些人跪在了地上，把一头驴作为上帝焚香敬拜起来。于是，查拉图斯特拉说话了：
你们也许真是高等人，但是在我看来你们还不够高超，也不够坚强……就算你们都属于我吧！也不能成为我的左右手。用了你们就会破坏我一切的胜利，你们之中，有些人一听到我的鸣鼓之声就倒了下来……你们的肩上有许多积压，许多回忆，许多恶意的侏儒盘踞在你们的角落里。你们之中，也带着隐秘的流氓气息。
就算你们是高尚的，属于高尚的一类，你们内心中还有许多歪曲和畸形。世界上却没有一个铁匠能够为我把你们锤直。你们只是桥梁：但愿更高超的人从你们身上度过去！你们代表了阶梯：因此不该怨怒那些超过你们而达到高超的人吧！我在这山上不是等待你们最后一次下山去。你们的来临只是一个预兆，预示着现在已经有更高尚的人在途中向我走过来。
翌日清晨，查拉图斯特拉从他的卧榻上跳起，束紧腰带，走出洞穴，强健且焕发，如旭日出自黑暗的山群中。
——全书到此结束。
《查拉图斯特拉如是说》这本著作，乍看起来，好像是醉汉的呓语，但细心揣摩，也不难领悟其中的线索和要旨：
第一，自古以来被人们称之为最完美的上帝是不存在的，如果说神创造了一切，那么人类岂不变成了只靠施舍的懒虫，成了无所事事的跪拜祈祷者。
如果有神，我怎能甘于不是神呢？因此没有神。
上帝是一种预测，但我希望你的预测不超出你创造的意志。最近我还看到他们在早上迈着勇猛的脚步跑出，但他们的知识的脚步疲倦了，于是都诅咒晨间的勇猛。诚然他们之中也有许多人像舞蹈者那样举着脚步，我的智慧的笑便向他们眨眼——于是他们自己沉思着。刚刚我又看到他们卑伏地爬向十字架。
第二，人要活得像个人样子，要站起来，“离开奴隶的幸福”！以基督教神学为基础的世俗道德，宣扬同情、怜悯，把人变成了驯服的家禽。
道德在于他们便是使人谦卑与驯服，以此，他们使狼化为犬，人便成为最好的家禽了。同情造成了一切自由心灵的沉闷空气。在山间多阳光的地方，我嘲笑一切怜悯，而且欢唱着。
第三，基督教造成的弱者的一切道德不仅包含着谦卑、驯服和怜悯的劣性，也形成了复仇、嫉妒的恶习。
这就是你们的真理；这些字对你们是太纯洁了，复仇、惩罚、报偿、酬劳……对于某些人，道德是鞭挞下的痉挛，你们也听到太多的这种哀号。有些人以他们的罪恶渐渐衰退而宣称为美德；当他们的憎恨与嫉妒松弛了手足，他们的正义活动起来，揉揉睡限。另有些人被拖下去：他们的邪恶拖着他们。但他们愈往下沉，他们的眼睛便愈殷切地期求他们的上帝。还有些人沉重地辗转而来，如同满载石子的卡车下山坡，他们谈论着许多道德和神圣——他们称他们的制动机为美德。有种人像时钟：他们嘀嗒嘀嗒作响，要人们称这“嘀嗒”的摆声为道德。有种人骄傲于他们少许的正义而施暴于万物：因而世界沉溺于他们的无道之中。
他们只是想借他们的道德挖割其仇敌之眼，他们高举自己，仅仅是为了压低别人。还有一种人，他们坐在自己的泥沼里，从芦苇中传出话：“道德——道德仍坐在泥沼中。”另有些人好作姿态，便以为道德是某种姿态。他们的膝常膜拜，他们的手常是道德的赞颂，他们的心中却什么也不知道。还有些人，认为这样说便是道德：“道德是必要的”，但最后他们只相信警察才是必要的。我从你们之中揭开了百种论调，取走了你最心爱的道德玩具，如今你们气恼我，如儿童之气恼。他们在海滨游玩，一个浪卷来，将他们的玩具卷到了深处：他们便哭泣，但相同的浪将带来新的玩具，而留下新的彩色的贝壳给他们。第四，否定陈腐道德，建立“坚强者的道德”，需要勇猛，“勇猛是最好的击杀者”。
我攀登，我攀登，我梦幻，我思想；然后一切压迫着我。但我内心却有着某种东西，我称之为勇猛：它为我粉碎任何颓丧。勇猛是最好的击杀者——勇猛攻击着：在每一个攻击中都传奏凯旋的乐声。人却是最勇猛的动物：因此他超过了任何禽兽，人以凯旋的奏乐克服了任何痛苦；人类的痛苦却是最深沉的痛苦。勇猛同时也击破了面临悬崖的晕眩：人生何处不置身于悬崖的边缘呢！勇猛是最好的击杀者：也击破了怜悯。勇猛是最好的击杀者：勇猛攻击着：甚至于将“死亡”本身也击杀了，因为它说：“这就是生命吗？好，再来一次！”在这些语言中，便有凯旋的奏乐，有耳朵的人，请听着吧！让一切东西破碎吧，还有许多屋子得盖起来。第五，人应当是一个具有道德勇气的动物。
然而，那些现代人、时代的主人们，仍深感于堕落的文化价值所熏染，他们都是市场上的苍蝇，在神圣的表皮下藏着可鄙的内容；他们只知从事蝼蚁的纷争，实质上却是畸形人。凡是柔弱的种性，凡是生于奴隶的种性，如今都成为一些人类命运的主人了。市场上满是吱吱喳喳的小丑——群众称颂他们为伟大的人！这些人便成为时代的主人。时代压迫着他们，于是他便转而压迫着你。有一天，查拉图斯特拉走过大桥，一群跛子和乞丐围着他，一个驼子向他这样说：“……你可以使盲者复明，跛子奔跑；这是使跛子相信查拉图斯特拉最好的办法！”查拉图斯特拉说：“当一个人取走驼子的驼背，那么也取了他的灵魂——人们这么说的。
当一个人使盲者复明，那么他会看到地球上太多的坏事情；如果使跛子跑步，那对他是最大的损害；因为他的罪恶会和他一起奔跑。——关于跛子，人们这么说的……”然而，这是我从群众中所看到的最小的事情：这人缺只眼，那人少只耳，另一个人又断条腿。我看见过更糟的事，许多人一无所有——这些人，不外是一只大眼睛，或一张大嘴巴，或一个大肚子，我称这些人为颠倒的残废者。
人们告诉我，这大耳朵不仅是个人，而且还是个伟大的人！是个天才呢！
第六，超人是以大地为基点，以自然为凭借，像古希腊自然主义者，使健康的生命从大自然中显露出来，在现实生命的管领中，使空泛的世界充满生机。
我的热烈的意志，重新迫使我走向人类：如铁锤之于石块。美丽的超人的形象向我移来，呀！同胞们，天神对我来说，算得了什么！
《查拉图斯特拉如是说》还以“精神三变”统领全书，表明了尼采思想的一个价值构架：
在这部著作中，尼采说：“我告诉你们精神的三种变像：精神如何变为骆驼，再由骆驼变为狮子，最后由狮子化为婴儿。”这里所说的骆驼精神是最初的负重精神，狮子精神意味着批判传统获得创造的自由，婴孩则喻示着新的生命、新的价值创造的开始。尼采在这部著作中，以“精神三变”为构架，显现出了自己总体思想的基本轮廓：首先把神圣的上帝从天国的宝座上拉下来。尼采向世俗的道德挑战了。世俗道德是以基督教神学为基础的道德，造就了人们谦卑、驯服、怜悯的劣性，也形成了人们复仇、嫉妒的恶习。尼采借查拉图斯特拉的说教，如同狂浪一般对道学者以猛烈的攻击，指出：“如：果有神，我怎能甘于不是神呢？”因为没有神，上帝只是一种预测。我们既然是人，要活得像个人的样子。这样，上帝死了，陈腐的道德被卷走了，代之而起的是一种反基督教传统的怯懦的道德，即现代人的道德。这些现代人是只知享受“可怜的安逸”的畸形。尼采发出了令人震撼的吼声：“重估一切价值。”他揭露了这些现代人是受了堕落文化价值的熏染，他既反基督教，又反世俗道德，在废墟上建立一套新的价值观念——以坚强者的道德代替儒者的道德，以创造的超人取代空幻的上帝，要以弘扬生命的意义而重建其尊严，要恢复健全的自我而发挥其潜能，在创造中显现人类高尚的价值。
《查拉图斯特如是说》还塑造了一个具有独特性格的人物形象一一查拉图斯特拉形象：
其一，他漫游于道德和宗教的禁地之上，神态犹如憨笑的雄狮，内涵着无比的威严。他言语不是文绉绉、气缓缓的满口学究味，而是豪迈慑人。
我是急流边的缆杆，抓住我吧，能抓住我的人。但我并不是你们的拐杖。至高山之脊、大海之间，一一如垂垂之云，飘悠于过去与未来之际。查拉图斯特拉兀立如醉人，眼神朦胧，语焉不详，足膝摇摆，有谁能猜透什么思想正驰过查拉图斯特拉的心灵呢？
其二，一种伟大的健康，既“更坚强的、更敏锐的、更健壮的、更勇敢的、更快乐的健康”。他的健康的消耗不是一种毁灭，而是一种创造，因此，健康需要继续恢复和增进，以发挥新的创：造动力。凡是灵魂需求体验以前的价值，并想在这一理想的地中海作一次周航，他们将从自己的深奥之经验探索中，得出做一个理想的征服者与发现者是什么样的滋味一一这样，他们也将知道做一个艺术家、圣者、立法者、学者、虔敬的人以及古老的隐居者是什么样的滋味——这样的人，先决：地需要一件东西，就是“伟大的健康”一一不仅只是静态的健康，而是不断的获取与必须获取，因为他要不断地耗费他的健康，并且必须耗费它。
其三，他喜欢翻山越岭，喜欢海洋，更喜欢海上的风暴，以锻炼体魄，开阔胸襟。海上风暴作了，一切都在海里。好吧！振作起来！你们老水手的雄心。当他走到山岭的最高处，看啊！另一面的大海在他面前展开了。到那里去吧，比暴风浪的海更奋勇，涌向我们伟大的遥情。
其四，拓展生命、奋勇创造的精神。他宣称，人是自我创造性的人，人的生命是自我超越的，意志是支配、是充盈自身的力量。人的意志让人规定一个高于自身生命的目标，向这个目标进发这是人的自我超越。生命想用大柱和阶梯把自己建筑在高处：它渴望望见辽远的地平线和幸福的——所以它需要高度……生命要升高，而升高时，它要超越自己。
这部著作乍看起来，似乎杂乱无章，支离破碎，但事实上，它集中地体现了尼采著作的独特风格。
尼采称他的《查拉图斯特拉如是说》体现出一种绝无仅有的新的艺术形式，其韵律之美，风格之宏伟，激情之惊涛起伏，均数独创。尼采的典型风格是格言和警句。在他的书里，找不到长篇大论和宏大庞杂的体系。他的著作，或是格言、警句的汇编，或是妙语连珠的散文。尼采对自己的这种独特的风格是极为自豪的，他说：“格言，警句——在这方面我在德国人中是第一号大师——是‘永恒’的形式；我的野心是要在十句话中说出旁人在一本书中说出的东西一一旁人在一本书中没有说出的东西。”有人对尼采说：“谁走你的路，必通向地狱！”尼采回答：“好吧！我愿用好的格言为自己铺设通向地狱的路。”尼采认为，格言的凝炼表现出力，格言的精致表现出美，运用格言的人必须有“最纤美的手指和最刚强的拳头”。他说：“在山谷中，最短的路是从峰顶到峰顶，但你必须有长腿才能跨越。格言便如峰顶，它属于伟大高岸的人。”在这个意义上，格言又如舞蹈，它跳跃、轻捷、自由，象征着自由思想的精神。
象征，是尼采著作的又一个独特的风格。由于长期生活在难以表达的痛苦之中，尼采在其著作风格上另辟蹊径，即把象征引入他的著作，使他成为一位象征主义哲学家。整部《查拉图斯特拉如是说》就是一篇象征主义哲理诗。尼采认为，哲学既然是对无限和永恒的追求，所以对哲学思想的表达当然不能不用象征手法。尼采的许多哲学范畴，如酒神、日神、超人、永恒轮回、强力意志等，与其说是逻辑意义上的概念，不如说是诗学意义上的象征。
尼采的《查拉图斯特拉如是说》，不仅是他写作风格的集中体现，也是他成熟思想的代表作。在这著作中，尼采一方面用较大的篇幅对他的超人进行了辩解；同时，对他从酒神精神到强力意志的全部思想，也作了明确、深入的阐发。有人说：“尼采的这部著作表明了他要以一种新的哲学、新的宗教、新的道路、新的途径，把德国人从旧哲学，从基督教道德的愚弄中，从软弱、退化的境况下拯救出来，恢复昔日的雄健、刚强和勇猛。重新建造出一种高于现实人类的存在，创造出一个新的世界和新的文化的远大抱负。”尼采也十分自信地说：“我认为将来总有一天会有很多的教授为我的查拉图斯特拉开设很多的讲座。而在目前：还会有相当长的时间内对我的查拉图斯特拉不予重视。如果在我生命的余年能够遇到五六个胸怀我的理想的人，我会多么惊奇啊！”
