玄奘再次委婉拒绝了唐太宗的劝请，他说：“玄奘自幼出家，弘扬佛法是我毕生的心愿。万望陛下大发慈悲，不夺我志。”
太宗毕竟是一位开明的皇帝，再次遭到玄奘的拒绝，他不但不生气，反而对玄奘更加敬佩。唐太宗心中暗暗惊奇：佛教究竟有着怎样的魅力，居然使得玄奘这样一个集天地之灵气的人物，死心塌地地追随其中，连高官厚禄、富贵荣华都不能动其心、撼其志！
于是，两人转换了话题。太宗问：“法师正在翻译哪部经论呢？”
玄奘回答：“五月十五日刚刚译完《瑜伽师地论》，共一百卷。”
太宗皇帝颇为惊讶地说：“哦，一百卷？此论甚大。但不知是何圣所说，主要内容都说些什么？”
“这部大论是弥勒菩萨所说，是一部讨论修行成道的书，把人生修行的历程划分为十七个阶段。故而也称作《十七地论》。”
《瑜伽师地论》的法理玄妙而深奥，讲识论思，体系庞大，术语甚多，玄奘只能举纲提目，陈列大义。不过，大论中也有一些通俗易懂的内容，比如“摄抉择分”的第六十一卷，主要分析了君王的种种过失、功德、衰损等。若君王避免失误、修习功德、远离衰损、掌握领导技巧，就能达到国家长治久安的目的。于是，玄奘着重给太宗皇帝讲解这一章节的内容。
李世民一生忙于军事和政治，虽然与僧人有过一些来往，但多限于礼节，且从心里轻视佛教，所以他刚开始听时，很是有点不以为然。可是，当玄奘讲到大论中所说的君王常犯的十大过失时，他的神情专注了起来。
“君王若出现这样的过失，虽然有雄厚的财力，有贤良的臣辅，有强大的军队，依然不可能得到人民的拥护，且危机重重，国家也将难以维系。”
大唐贞观盛世的出现，最重要的前提就是唐太宗李世民的励精图治、从不放逸，任人唯贤、远离邪佞，从善如流、赏罚分明，避免了佛经之中所列举的那些失误。因此，他现在听来深有体会，倍感亲切，频频颔首称是。
玄奘见状，知道太宗认同了《瑜伽师地论》中的这些精辟分析，于是又讲了君王的五种领导技巧：第一，善于观察、统御群臣，充分发挥每一个人的特长；第二，广行恩德，宽以待人；第三，专注政务，不放纵自己；第四，远离奢靡，勤俭建国；第五，遵守纲纪，专修善行。
李世民心中暗暗吃惊。大唐的基本国策是儒治为主，诸教并容。因为他一直认为，佛教是遁世的学说，于百姓无补，于国家无益。没想到，《瑜伽师地论》的政治理想，与他的治国之术有异曲同工之妙。他立刻派人骑快马回长安，去把《瑜伽师地论》取来。
唐太宗详览《瑜伽师地论》，见其词义宏达、闻所未闻，情不自禁地对身边的大臣说：“朕观佛经，犹瞻天俯海，莫测高深。玄奘法师能于异国他乡取得这样的妙法，真是奇迹。朕原来忙于军政，没有认真研究过佛教。儒家、道教以及其他九流的经典与之相比，就像小池塘与渤海。人们都说三教齐致，真是妄谈。”
从来没有认真读过佛经的唐太宗，一览《瑜伽师地论》便叹为观止。他下令秘书省将玄奘新译的佛经手写九部，分发于九州流通广布。这是唐朝早期官方写经流通规模最大的一次。
七月十三日，唐太宗李世民在玉华殿举行了一个庄严的仪式，赐给玄奘一领袈裟。这件袈裟是后宫费时数年之久的精心之作，用金缕织成，根本看不出缝合的痕迹，美其名曰“天衣无缝”。多年来，太宗皇帝一直在观察全国的高僧，为其寻找最合适的主人。现在他知道了，只有玄奘才配得上这件佛门重宝。于是，他亲自将金缕袈裟披在了玄奘的身上。
七月，在玉华宫还发生了两件让太宗皇帝黯然神伤的丧事：一代名相房玄龄与宋国公萧瑀在这里先后去世。李世民眼睁睁地看着这些与自己出生入死的老臣一个个撒手归西，倍感生命的无常，因而对佛教兴趣大增，精神上更加依赖玄奘，几乎将其当成了自己的心灵导师，一直让他陪伴在自己身边。两人相得益彰，太宗完全放下了皇帝的架子，对待玄奘如同亲人一般。
这样，当玄奘再次请求太宗皇帝为自己的新译佛经写序时，他欣然同意了。八月，太宗亲笔撰写了《大唐三藏圣教序》，并在玉华宫庆福殿举行了宣序仪式：唐太宗尊玄奘为上座，太子李治，重臣长孙无忌、褚遂良、许敬宗等人肃立两侧，令弘文馆学士上官仪当庭宣读。
唐太宗在序文中一反初衷，把佛教誉为“圣教”，并用华丽的言辞对佛教和玄奘大加赞赏。这些都远远超出了玄奘的预料，所以他喜出望外。太宗对他个人的溢美之词，他固然欢欣，更重要的是，有了太宗这篇热情洋溢、霞焕锦绣、褒扬之至的序文，对于他所翻译的佛经流传天下，大有益处。
太宗李世民年轻时期，恰逢隋末战乱，他以卓越的军事才能北征东伐，为大唐创立了不朽的勋业。与一般冷血帝王不同的是，他的内心世界极为丰富，情感细腻、敏锐。一方面，他觉得以战终战、以杀止杀，势在必行；另一方面，他良心发现，自知杀业太重，感到非常后悔。到晚年，这种发自内心的忏悔让他坐卧不宁。而玄武门事变中，兄长李建成与弟弟李元吉的惨死，在太宗的心灵深处留下更深的暗影。多年来，这件说不出口的往事，在胸中累积成了一个大疙瘩，无形的压力与恐惧时时刻刻跟随着他。他内心的苦楚以及寻求解脱的紧迫感，唯有佛教的因果之说和树立福田的办法才能解决。所以，他开始相信佛教，与玄奘几乎形影不离。为了时时能与他相见，太宗专门在玉华宫为玄奘增设了译经院。
晚年的太宗皇帝，自从远征辽东以来，精气神大不如前。再加上前期服用道士丹药的副作用，健康状况急剧恶化。自从六月听从玄奘的劝告，摒弃“长生不老”的灵丹妙药之后，反而神清气爽，体力有所恢复。他理所当然地将之归结为结缘佛教、亲近高僧玄奘的效果，因此对佛法更加虔诚恳切了。十月初的一天，他问玄奘：“作什么功德，利益最大？”
玄奘回答道：“众生迷惑，没有智慧不足以启发，而培植慧根最好的方法就是弘扬佛法。住持正法，仰仗的是寺院僧人，所以度僧的功德最大。”
太宗李世民听了很高兴，随即下诏：“京城及诸州各寺，各度五人，弘福寺度五十人。”当时，大唐各地共有官寺3716所，共度僧尼18500余人。在此之前，因遭到隋末战乱的摧残，国内寺院凋残，僧尼散失。有了这次大规模的度僧，佛教开始再次兴盛起来。此后，尊崇佛教很快成为民间风尚，建寺院、开石窟、造佛像、修佛塔，中唐之后渐成繁盛气象。
皇太子李治每逢阴天下雨，手心即痛。他因此想起自己年幼时，常常看到娘亲腹痛。当时不解，如今自己长大成人了，感同身受，非常思念亡母。于是李治效仿老爹，为报答母亲文德皇后的养育慈恩，在隋代无漏寺的故址上兴建大慈恩寺。
十二月间，寺院落成，皇太子亲自拈香，拜佛像幡华，度三百僧，别请五十大德，迎请玄奘为上座。且于寺的西北部筑造翻经院，安置玄奘所携回的经像舍利，随后玄奘在这里继续译经事业。
玄奘迁居慈恩寺之后，除了译经事业之外，又增添了许多寺务管理工作，超常繁忙，所以没有时间陪伴太宗皇帝。在此期间，大臣王玄策从印度带回了一位婆罗门外道。为迎合皇帝祈求长生的心理，把他献给了李世民。这个印度外道吹嘘自己已两百多岁，有长生不老之术。唐太宗信以为真，将他安置在金飙门客馆为自己炼制丹药。然而，印度外道的长生不老之药与中国道士的仙丹一样，服用之后不但毫无作用，反而大大加深了汞铅中毒的症状，令唐太宗头痛不止！
贞观二十三年（公元649年）四月，太宗皇帝的身体每况愈下，不得不到终南山翠微宫休养。此时的太宗，已经预感到自己来日无多。他几乎每天晚上都做噩梦，梦中形形色色的敌人向他索命。显然，病情日重、中毒已深的太宗皇帝，其心难安。
空前绝后的千古一帝，英勇盖世，智超群伦，一生戎马，征服四方，到临终之时才发现，最难征服的居然是自己的心！然而，他明白得太晚了，已经没有修心的时间与精力了。为了寻求心灵的慰藉，他请玄奘前来，不让他离开左右。唯有玄奘以佛法疏导，才能减轻他心中的痛苦与不安。
无可奈何，玄奘只好将译场搬到翠微宫的安喜殿。白天，太宗处理政务时，玄奘译经。其余时间，两人像亲密无间的老朋友一样，谈经论道。此时的太宗皇帝，对自己早年未能修学佛法而后悔，对玄奘说：“朕与法师相见恨晚，不得广兴佛事。”太宗所说，当是肺腑之言。正如曾子所说：“鸟之将死，其鸣也哀；人之将死，其言也善。”
五月二十四日，太宗皇帝头痛消失，精神大好。然而，心明眼亮的玄奘知道，这不过是回光返照。于是，他将陪伴自己度过了许多苦厄的《心经》，诵给唐太宗听：
观自在菩萨，行深般若波罗蜜多时，照见五蕴皆空，度一切苦厄……无挂碍故，无有恐怖，远离颠倒梦想，究竟涅槃。三世诸佛，依般若波罗蜜多故，得阿耨多罗三藐三菩提……
太宗皇帝心性异常通灵，明白了自己因为牵挂太多，所以心生怖畏。由是，他不再想世俗的烦恼，忘记什么功过是非，不再惦记必将属于他人的江山社稷。放下一切之后，他感受到的是空空明明的清凉。
五月二十六日，中国历史上最杰出的帝王李世民，耳边徐徐回荡着玄奘低沉、舒缓、平静的诵经声，在翠微宫安详而逝。
