海军秀英港，军地两方有关人员齐集，一位有级别的首长严肃地对叶立颂说道：事关国家利益，面对威胁、利诱、拷打，请如实告诉我们，苏阿敏在什么情况下会泄漏机密？叶立颂不假思索：什么情况下都不会！苏阿敏除了美丽，沉稳，机智之外，是个绝对忠诚于理想、绝对忠诚于事业、绝对忠诚于祖国的人，她既有破釜沉舟，以死报国的勇气，又有审时度势，绝地反击的顽强，在科考船遭遇危机的时候，苏阿敏必然是一个会发挥作用的人物，她会是一个核心。
海上，风高浪急，杜尔伯艰难地向苏阿敏解释着为什么拿了赎金不放船。苏阿敏似乎并不意外，在揭穿强盗逻辑的同时，开始思索如何销毁资料、避险和自救，她提出要见船长。
杜尔伯不想在苏阿敏面前表现的过于卑鄙，思索再三，终于让苏阿敏与船长见了面。苏阿敏平静地询问：我们很危险是不是？船长思索后说道：不一定，一般情况下，海盗要钱不要人。苏阿敏：船本身会发生危险吗？比如触礁、失火、沉没。船长：不会，马六甲海峡是黄金水道，广州至悉尼的船每天对开一班，失火、沉没也不会，除非有人故意沉船。苏阿敏：要是碰见广州的船会好些吧？船长摇头：拯救的要素是人质安全，民船办不到，除非海军特战队！苏阿敏坚定地说道：海军特战队会来的！船长：凭着你给丈夫的SOS？苏阿敏神秘地一笑：我相信我的作家丈夫有足够的思维能力！
H。S开会做出了部署：一、要让科考船因为一起被公共认可的事故沉没；二、沉没之前将船载核心设备分离；三、苏阿敏在劫船事件中罹难，尸体丢失。H。S的目的是：以此种被他设计出的方式得到“808”的核心技术和项目主持人，而又不承担法律及舆论责任。
这个阴险的方案通过销赃机构“海上物资交易中心”传达给了执行人“活水堂”。
肖大鹰面对海图计算：科考船设计航速为14节、最高航速15节、目前航速12节，我舰设计航速26节、最高航速28节、目前航速27节，两船航速不变，48小时可以追上科考船。舰长担忧地说道：但我们的油耗将提升很多，续航能力相对减少，设备要经受严峻考验，危险成倍增加。肖大鹰说：我们是军人，军人本来就是危险的法定承担者！舰长转身一声命令：两车！前进四！
指挥中心与科考船通电报：报告你们的位置！南嘉树回电：正在穿越詹布亚逸角与槟城连线，四小时到达规定海域。指挥中心：你们有义务把船停泊在指定海域，我们是同意付钱的！南嘉树：我们保证人船安全……
面对中国方面的严密监视，南嘉树告诉杜尔伯，为了减少麻烦，要将苏阿敏之外的人抛入海中，杜尔伯坚决反对，说海盗和杀人犯不是同一概念，并且指出，H。S提供的微潜艇不足以运载核心设备，争论很久之后，双方妥协：一、杜尔伯运用技术将科考船悬浮于海平面之下，造成沉船假象，使中国放弃寻觅；二、伪造船体失火，利用假失火将船员用救生艇转移，并保证人员安全；三、以微潜艇拖拽，使科考船在海平面下移动至另一海域，交付H。S方面。
杜尔伯的计划得到了H。S的批准。
屏幕上，科考船突然向西偏航14度，指挥中心与科考船通电报：为什么偏离航线？报告你们的位置！南嘉树回电：不知道，罗盘坏了！
指挥中心的大屏幕上，卫星照片被尽量放大，船体上空出现浓烟。
指挥中心：发生了什么事？
南嘉树一脸冷酷：油库失火……
指挥中心：不要耍花招！
南嘉树转用明码，连续发出：SOS……SOS……
指挥中心：到底是怎么回事？
南嘉树笑了笑：Save Our Ship……
科考船上突然发出的滚滚浓烟，令苏阿敏震惊不已，当杜尔伯前来转移她下船时，她坚持不见船长不离舱房，杜尔伯反应到苏阿敏见船长是要证实事故的真伪，便加以拒绝。明白自身价值并怀疑可能遭遇绑架的苏阿敏将一支安瓿置于齿间，义正词严：船是祖国的移动领土，华夏儿女死不弃国，五分钟之内见不到船长，我两唇一动，捐躯故园！
杜尔伯见状无奈，远远地押郑亚非船长至舷边，却以全体船员生命要挟，禁止船长开口讲话。
苏阿敏手指浓烟大声询问：你告诉过我的，船不会失火！船长取出一支香烟，猛吸一口，昂首吐向天空，随即转身离开。
苏阿敏看着香烟与浓烟慢慢溶合，稍一思忖，顿开茅塞。
杜尔伯再度促请苏阿敏离船，苏阿敏铁嘴钢牙：与船同沉！
护卫舰上肖大鹰了解到科考船冒烟，十分震惊。
舰长给他进行了专业分析：科考船全长60米，舷宽26米，满载排水量2560吨，钢质全焊接结构，续航力8000海里、自持力40天、最大航速15节、6级海况可正常作业，是我国目前最先进的综合科学考察船之一，安全度极高，附近海域无其他船舶航行，卫星监视无碰撞，燃烧的可能只有两种：一、海盗焚船；二、船员死节。但是，赎金已同意支付，海盗焚船无利可图；明知有舰来救，船员以死殉国莫名其妙。
肖大鹰敏感到海盗们在搞阴谋。
无法判断科考船“求索号”真相，但“求索号”有危险是一定的，肖大鹰下令：超速前进！
超速前进——这意味着护卫舰行驶将不再安全、故障将随时发生、油料将迅速耗尽……
面对这一切，肖大鹰的态度是：18小时赶到出事海域，纵然是军舰解体，咱当兵的也要登上科考船！
舰上向岸基报告：我舰正以32节航速追击海盗，请通知最近船只改变航线援助科考船！
杜尔伯开始沉船，他再三劝告苏阿敏：你无论怎样都不会死，但船舶将沉入海平面，水面飘浮的救生舱装不下你的全部同胞！苏阿敏猜测到“活水堂”有阴谋，便以死相逼加以询问。杜尔伯暗示了H。S计划的梗概。苏阿敏又问：你是中国人吗？杜尔伯回答：二分之一血统。苏阿敏规劝：老话，放下屠刀……杜尔伯打断：我成不了佛也帮不了你，南嘉树控制了一切！
这边，叶立颂被请到指挥中心分析苏阿敏的心态。
面对一张张焦虑的面孔，叶立颂平静而坚定地说道：苏阿敏的生命属于国家，一不会为外人利用、二不会轻易自尽，哪怕受到欺负，她是司马骞一样的人物，虽刑余而可著《史记》！
科考船“求索号”开始下沉，很快，海水漫上甲板。
杜尔伯再次劝说苏阿敏下船。
苏阿敏冷静地要求再次会见船长。
海水至膝，船员及科技人员庄严肃立，面无惧色。
船长郑亚非手捧五星红旗下达了命令：全体船员及乘员弃船！
人们缓慢登上小艇。
小艇驶向小岛。
甲板上水漫腰间，海盗之外，惟余苏阿敏与船长对视。
苏阿敏面对船长以目光询问：您真得要留在船上？
船长默默点头。
苏阿敏的泪水喷薄而出，她双脚立正，庄严地弯下腰，向着手捧国旗的郑亚非船长深深地鞠了一躬……
