公元2136年,一枚名为“哈米吉多顿”的小行星坠落地球,史称“大灾变”。一时间,天地变色,万物蹉跎。人类文明分裂为两支:以现代文明为基础,苟延残喘的“旧”人类,以及适应环境,投身自然的变异者,双方隔阂重重,彼此征战不休。公元2236年,“大灾变”一百年后,一位神秘女孩在人类东方定居点出现,她以军方密探的身份,铲除一切有害于人类的敌人。与此同时,在东方定居点的贫民区,发生大规模屠杀居民的事件。这被认为是对政府权威的挑衅。军方为之震怒。他们派出重兵,发誓要将敌人彻底清除。巨大的阴云笼罩长江,恍惚间,一场暴风雨已经近在眼前。