孙禄堂的武学体系是以《易经》为立论，以儒释道诸家学理为参照，不仅在技击功能上是对当时武学研究水平的全面超越，而且构建了道艺武学哲武一体、体物不遗的修身学说，使孙氏武学成为支撑、验证、完善中国传统哲学的根基。
因此，孙禄堂的武学体系堪称是16世纪以来直到今天中国武学发展的最高成就。当年曾令海内精技艺者无不望风倾倒，著名学者如马一浮、胡朴安、蔡元培、陈曾则、刘春霖、陈夔龙等对孙皆持弟子礼。
中华武艺复兴是以16世纪为起点，以战阵、齐勇为表征的军旅武术为发端；到17世纪、18世纪武术朝着单兵化、徒手化、养生化演化，以及开始将导引吐纳引入武技的研修，并将对技法的研究逐渐发展到对劲力研究的层面；到19世纪，随着对劲力研究的不断深入，发现了各家武艺若干普遍法则，产生了以劲力特征卓然于时的几大拳系；再到20世纪初，最终由孙禄堂发现了技击运动的根本规律，构建了拳与道合的中华武学体系，是16世纪至20世纪中国武学发展的基本脉络。然而20世纪初当孙禄堂完成构建了拳与道合的武学体系之时，也正是中国文化受到西方文化强劲冲击乃至分崩离析之时。随着新文化运动对中国传统文化的批判，以及西方文明的巨大成功所形成的文化强势，使得孙禄堂的武学体系所代表所蕴涵的文化与当时的文化潮流难以抗衡，因此其巨大的文化价值并没有被当时社会所认识。只有极少数文化精英能够感悟到孙禄堂武学体系的人文内涵和巨大的文化价值，但是他们在武功上造诣不深，难以承担起继承、发扬道艺武学的学术重任。因此，孙禄堂的武学体系从其完成建构的那天起，就开始面临着被淹没的窘境。孙禄堂曾感慨道：“吾言虽详且尽，犹虑能解者百人中无一二人。吾惧此术之绝其传也。”由此可见，在20世纪初的中国社会，能够理解孙禄堂武学体系的人是非常罕见的。
19世纪末到20世纪初是中国社会急剧动荡的时期，自鸦片战争之后，经过太平天国、甲午战争、庚子之乱等来自内外的动荡与冲击，使国人不仅认识到西方在技术上的优势，也使越来越多的人对西方的一切包括文化由惊恐畏惧转而为崇拜，随着五四运动发出打倒孔家店的口号，国内一批知识分子阶层对传统文化的否定达到了一个高峰。因此这一时期的武术家群体对建立在传统哲学基础上的中华道艺武学体系，或因为文化根基所限而不能明其所以，或由于受到西方体育思想的影响而怀疑甚至全盘否定，导致孙禄堂的武学的成就难以被当时大多数人真正理解和接受。因此，客观上造成了代表中国武学最高成就的孙禄堂的武学体系，在刚刚完成，尚未被人们充分认识，就迅速进入了“冰河”期。这是在时代大更迭与文化大冲击的过程中之大势使然，非学术价值本身所能左右。这也就决定了中国武学的发展在孙禄堂之后，在学术上未能进一步上升，而是出现明显的滑落。
1918年10月，徐世昌当选民国总统，聘请孙禄堂任总统府武承宣官，负责徐世昌的保卫工作，直到1922年徐世昌下野。在这期间，RB全国柔术冠军阪垣曾访孙禄堂较艺。孙禄堂轻取阪垣。据《世界日报》记载：“民国八九年间，孙在京时。时有RB著名柔术家阪垣者，来游中国，恃其柔术与华人斗，所向无敌。因之阪垣骄甚。嗣闻孙禄堂之名，即访孙，请一较身手。孙对阪垣谦逊如常，不肯较力。阪垣误以为孙为胆怯，请较益坚。孙力辞不获，乃允之，并依阪垣所提出之比赛方法，于客厅中设一地毯，二人并卧其上，阪垣以双腿夹住孙之双腿，两手攀抱孙之左臂，曰：‘余将使用柔术，只需两手一搓，汝左臂将断。’笑答曰：‘请汝一试可也，余意制之亦非难事。’阪垣闻言，露惊骇之态，即开始用力，孰知刚一发动，两臂如受重大打击，寻且震及全身，此时阪垣非惟手腿不能坚持孙体，即全身被震，滚至离孙两丈外室隅处。四旁站立之孙之弟子及外界观众甚多，至此莫不大声喝彩。阪垣自地爬起，脸红耳赤，恼羞成怒，突由身旁掏出手枪，孙之弟子方欲上前制止，孙从容谓曰：‘不必不必，看他如何打法。’乃立于阪垣对面靠墙而待。阪垣举枪瞄准，自意必中，谁知枪声响毕，阪垣视之，已失孙所在。方诧异间，忽有笑声发自阪垣身后，反视之孙也。盖阪垣动枪机时，孙即一跃至阪垣身后矣。至此观众哗然大笑，阪垣垂头丧气辞出。数日后，阪垣请托多人说孙，欲从孙学艺，孙未允焉。”
1922年夏，孙禄堂的三子孙务滋在太仓中学教授高低杠时，因杠子突然折断，锈螺丝扎入肋骨中，由此感染破伤风，不治身亡。孙务滋的去世使孙禄堂极为悲伤，孙禄堂很重视对孙务滋的教育，使孙务滋在中、西学方面均受过较系统的教育，因此，孙务滋的早逝对孙氏武学的继承与发展，都是难以弥补的损失。在给儿子送葬时，一向能够控制自己情感的孙禄堂手抚儿子的棺材大声说：“老三我哭你一声吧！”声如霹雳，悲伤至极，一口血随之喷出。
1924年，孙禄堂出版了堪称武学经典的《拳意述真》一书，前辈宋世荣看后，惊叹不已，邀请孙禄堂去山西见面。时宋世荣在介休，孙禄堂到太原后由宋世荣的徒孙董秀生一路陪同，拜访宋世荣及山西各地同门，宋世荣精通内功修炼，当亲眼目睹了孙禄堂的武功后，宋世荣异常兴奋，在《拳意述真》的扉页上写道：“禄堂仁棣：学于后，空于前，后来居上，独续先宗绝学。”认为孙禄堂的武功已经超逸前代，独续绝学。
孙禄堂与宋世荣交流数日后，在返回北京时途径省城太原，这时一路上陪同孙禄堂的董秀生，亲眼目睹了孙禄堂的武功无人能及，因此一再要求孙禄堂留在他家，以便向孙禄堂深入地请教学习，于是孙禄堂逗留董宅月余。期间，孙禄堂曾蒙目同时与十几位练了多年武功的青壮年交手，连试了多次，每次都在一瞬间，孙禄堂就把他们一个不剩地打翻在地。观者无不惊骇，叹为奇迹。月余后，因北京来函紧催，于是孙禄堂返回北京，临行前，孙禄堂为董秀生的府邸题词：“养性轩”。多年后，董秀生的胞弟董子英对著名记者姜侠魂讲：“孙禄堂先生道德极清、武功极高，其德之清，如天也，无所不容，其艺之高，盖世也，无人可及。其德其艺非世人所能测所能知者，其知其行与古之圣贤大德足可比伦，至于技击末技合于道体，神乎其神，更遥遥不能望，无可比伦者也。今有得其拾一者，足可独步一时矣。余兄与先生交厚，尝叹曰千古奇人耳。”
1925年的一天，孙禄堂突然接到新任直隶督办、剑术名家李景林的邀请，特邀孙禄堂去天津会晤。原来当时李景林部的武术教官是八极拳名家李书文，李书文擅长大枪，很少有他看得起的人，一些被李景林请来的武术名家，竟被李书文在比武中击伤，然而李书文惟对孙禄堂的武功称赞有加，因李书文也曾参加过天津的中华武士会，与孙禄堂有过交往，每与李景林谈到当代武术家时，李书文总是推崇孙禄堂，称孙禄堂是当今武林的第一高手。所以，李景林邀请孙禄堂到天津一晤。孙禄堂到天津后与李景林交流了剑术，令李景林深服之。之后，李景林重金礼聘孙禄堂帮助其整理武当剑法，故李景林之武当剑吸收孙禄堂之八卦剑、纯阳剑部分精义。孙禄堂亦认为李之武当剑也有独到之处，故在孙禄堂所创太极剑中亦部分吸收了武当剑的精粹。
1926年，孙禄堂得道友关某（失其名），经常二人同处一室，闭门修习道功，一同合道修真。其法，不传六耳。据孙剑云讲，乃父练功时是不让人看的，即使对子女也是如此。不久孙禄堂之《八卦剑学》出版，阐发慧剑之旨。
1928年3月24日，中央国术研究馆成立，正理事张之江，副理事李景林。4月，孙禄堂被聘为中央国术研究馆的教务主任兼武当门门长。4月下旬孙禄堂以古稀之龄乘船由天津到达上海。受到上海国术界和学术界的热烈欢迎，并在上海做了几场国术交流，社会为之轰动。上海国术界极力挽留，逗留竟旬。经张、李正副理事力邀和催促，孙禄堂于5月7日到达南京，8日中央国术研究馆举行了盛大的欢迎仪式同时举行开学典礼。
在举行开学典礼中，突然有人喧哗，公然向孙禄堂提出比武挑战，一些人随之哄声大起，孙禄堂对挑战者说：“今天本是馆方举行开学典礼，如果馆方同意即刻改为比武擂台，我将与诸君比试切磋。”这时李烈钧、李景林站起来力劝孙禄堂先生与他们一起离场。而张之江、马良留下来安定会场，会场形势混乱一团。事后在李烈钧、张之江等人的责令下，挑战者向孙禄堂当面赔礼道歉。这件事并非偶然，而是反映了当时一些习武者好勇私斗的江湖习气。而这种习气正是孙禄堂要力行改变的东西，孙禄堂提出，习武者要动之以礼，倡导刚勇和平。
孙禄堂上任后，作为教务主任立刻要着手两件事，一是与正副理事共同确定教学计划与内容，二是与馆内董事及正副理事共同商议给馆内各位教师定级。但不久孙禄堂就发现馆内教师多有军政背景，对自己布置给他们的工作，并不认真执行。当时中央国术研究馆的教师主要由两个系统的人员组成，一个是西北军的张之江系统，另一个是军警的马良系统。张、马两个系统的人员之间存在很深的派系矛盾，尤其是给每位教师定级，涉及每个人的切身利益。由于孙禄堂是盛名全国的国术家，即非西北军系的人，又不是马良军警系的人，双方都希望借助孙禄堂之口，来顺利给自己系统的人定级。孙禄堂不想被卷入其中。因此孙禄堂上任不到两旬，5月下旬正式向馆方提出辞呈。孙禄堂去意已决，李烈钧、张之江、钮永健、李景林等人苦留不住。
由于李烈钧、张之江、钮永健和李景林等人对孙禄堂先生的武艺、学识和人品极为钦服，因此李烈钧、钮永建出面决定成立JS省国术馆，请孙禄堂全面主持江苏国术馆的教务工作。并于6月1日召开了筹备成立JS省国术馆的董事会。此外由于孙禄堂的辞职，原本跟随孙禄堂到馆中任职的孙存周、李玉琳等也将与孙禄堂先生一同辞馆，因此中央国术馆缺少教授形意拳的教师，因此馆方请孙禄堂介绍一名教授形意拳的教师来后再走。这样孙禄堂就派其子孙存周和弟子李玉琳借去上海俭德会洽谈教学事宜之机，叫自己在上海的弟子高振东来中央国术研究馆教授形意拳。
1928年7月1日江苏国术研究馆正式成立，同一天，聘孙禄堂任该馆的教务主任。8月国术研究馆更名为国术馆。12月各省国术馆统一组织设置，省国术馆设立教务长，教务长之下设教务主任，教务主任之下设教习，教习之下设助理教习，助理教习之下设练习员。因此，同年12月9日聘任孙禄堂为江苏国术馆教务长，后为副馆长。当时江苏国术馆的教习中有不少是著名武术家，如孙存周、孙振岱、胡凤山、杨澄甫、田兆麟、金佳福、徐铸人、金淑英、郝月如等。
孙禄堂在江苏国术馆任职三年多，这是由于江苏国术馆的办学宗旨与孙禄堂的武学思想比较接近。江苏国术馆办学宗旨是：1.倡导国术的作用在于恢复中华民族的生命力，这种生命力体现在心力与体力两个方面，两者的关系相辅相成。2.提出江苏国术馆成立的意义在于使人民认识到国术便是中国固有的“提升生命力的艺术”。同时要把这“生命力的艺术”输送到全民的生活中去。3.反对并轻蔑好勇斗狠，提倡通过拳术造就的刚勇是为了守卫和平的思想。提出“刚勇和平”的馆训！后来在张之江和李英石再三的邀请下，孙禄堂每月又在中央国术馆和上海俭德会兼课。
孙禄堂反对门户之见，认为把内家外家和武当少林联系起来是毫无根据的，他在《论拳术内外家之别》一文中指出：“无论武当、少林，凡得中和，善养浩然之气者即为内家”。也就是说，拳术只有是否合乎中和这个道理之分，合乎中和者，不管形式如何，都是一家。并且率先倡导国术的统一。引领着当时的国术运动向正确的方向上发展。孙禄堂在上海收徒时立下三严三同的规矩：“凡我弟子，均应做到三严三同。三严即严格锻炼，严格要求，严守武德；三同即同门之内，同门之外，同道之间，应一视同仁，反对派别倾轧。”又说：“拳为强身养心之道，也是自卫除暴之术。久练功成，自然罡气内布，力量神奇。然而此时更要严守武德，不可轻易动手伤人。倘遇强徒横行，则务必不畏强暴，挺身而出，予以整治。”
孙禄堂在南方期间，还与李景林先后组织、主持了历史上规模最大的两次国术擂台大赛：ZJ省国术游艺大会和上海国术大赛。倡导技击实践。孙禄堂任ZJ省国术游艺大会筹备副主任和副评判委员长以及上海国术大赛评判主任。两次大赛的名列前茅者几乎一半都是孙禄堂的弟子、学生。时论这两次大会的武技以李景林之剑、孙禄堂之拳最为精湛。两次大会中众多国术名家的武技表演被拍摄成纪录片，该纪录片片名就是《李景林之剑、孙禄堂之拳》，为后世留下极为珍贵的武术资料。在ZJ省国术游艺大会举行期间，评判委员之一，来自郭云深同乡的王芗斋对外声称他是郭云深的关门弟子，并说现在流行的形意拳把真谛都丢了。有人问孙禄堂这是否是真的。孙禄堂说：“从没有听说郭先生的弟子中有个姓王的。”不久孙禄堂的弟子胡凤山与王芗斋切磋武技，一连切磋了三次，胡凤山三次击倒了王芗斋。于是，形意拳孰真孰假不辩自明。
这两次擂台比赛不仅震动全国，而且波及海外，RB武道界也高度重视并研究了这两次比赛，他们从RB全国筛选出五位技击格斗高手，来中国再次挑战孙禄堂这位中国武术界的象征性人物。他们知道孙禄堂不仅多年前轻取板垣，而且曾获世界格斗冠军。因此他们打算利用孙禄堂年过古稀的现状，采取车轮战术，跟孙禄堂比武。
这天，RB这五位格斗高手和一位RB领事馆的翻译来到孙禄堂的住处，向孙禄堂提出挑战。孙禄堂决定以一对五，同时与五位RB格斗高手进行较量。由于这五位RB格斗高手都擅长地面固绞的技术，为了让这五位RB高手能以他们最擅长的技术与自己较量，因此孙禄堂说：“我躺在地上，你们五个人以任意方法按住我，你们另一个人喊三下，如果在三下之内我不能起来，就算你们赢了。”这话由那位懂中文的RB人翻译过去，几位RB人觉着这是个玩笑，最后经孙禄堂再次确认这个比试方法后，他们同意按这个方法比试。于是孙禄堂平躺在地上，五个RB人，其中一个最魁梧的，骑在孙禄堂身上，两腿将孙禄堂的身体盘住，并用双手锁住孙禄堂的头，其他四人，以他们各自的方式固锁住孙禄堂的四肢。另一人喊：一、二、三字尚未出口，只见孙禄堂一跃而起，五个RB人都被放出两丈外，扑倒在地，一时竟未能起身。孙禄堂将他们一一扶起，他们惊诧万分，由一人说了句抱歉之类的话，就惶恐地离去了。第二天他们又来到孙禄堂的住处，这次多了两人，一共8个人，除了昨天6个人外还有两个是RB领事馆的官员，他们说：RB天皇邀请孙禄堂去RB教授武技，每月报酬达两万块银洋。请孙禄堂至少去一年。孙禄堂说：“我老了，哪儿都不去了，如果你们想研究我国的武术，可以与国术馆联系，那里的教师更年富力强。”他们再三恳请，孙禄堂还是婉言谢绝了邀请。从此孙禄堂被RB武道界尊为武圣，被称为文武两道三大雄。
1931年，孙禄堂欲寻慧达之人继承自己之拳学。于是登报招收弟子。此前孙禄堂曾寻天赋慧达者数十年，始终未遇。唯海桂元天赋尚可。可惜，1928年5月海桂元随张作霖出关时被炸死（海是张作霖的贴身秘书）。孙禄堂此番招徒条件有三：1、本人酷爱武术，三年之内不准备从事其他事业者。2、大学文化程度。3、面试合格。仅一周，报名者已达两千余人，孙禄堂从中择出三人，认为条件尚可。决定使三人各承自己一门拳学。然而同年9月，“九?一八”事变爆发，不及一月，整个东北沦陷。孙禄堂对当时国民政府的不抵抗政策非常失望，对国家的前途深感忧虑，抱憾中断传授，毅然辞去江苏国术馆副馆长的职务，返回北平，劝说其在北方军队中的弟子组织抗日。
回到北平后，北平国术馆副馆长许禹生多次登门请孙禄堂出山，孙禄堂婉言谢绝。其间，尚云祥、邓云峰、张秀林、刘彩臣、马贵、恒寿山、刘斌人等常到家中向孙禄堂请益。切磋中，众人莫不惊服，叹孙禄堂技高不可测也。
孙禄堂的武功早已达到超神入化、与道合真之境，而且不断升华，故其技击造诣空古绝今，被世人疑之为神。孙禄堂与当时几乎所有的武林高手都有交流，未尝一负，未遇其匹，独步当时。在当年多有记载。此外其弟子学生对其武功也有详细的记述，下面仅摘录若干事例，以管窥一斑。
