政变后的几天中，维新派和支持变未能的帝党官员或被捕、或革职、或遭终身监禁，无一幸免。对于一切新政，当然要一律推翻。慈禧为了表明她“勇于纳谏”和并不专权，一天，她询问大臣：“新政和祖宗的法各有什么利弊？”在场的荣禄装着很公允的样子说：“变法是为了富强，也不是不可以。但富强之道，无非是开矿、通商、练兵、制造机器罢了。其他治国的大经大法，祖宗早就替我们想得很周到了，决不允许有什么变更。”与此同时，朝中的满族官员还联名上疏，请求慈禧废除新政。这样已经废弃的八股制度，已经裁撤的衙门，已经罢免的官员又统统恢复了。
慈禧是一心想废黜光绪的。但是，了解中外大事的军机大臣荣禄不赞同此事。然而劝说慈禧谈何容易，荣禄为此内心极为焦躁。适逢大学士李鸿章受谕任两广总督。在上任前，他向荣禄辞行，见荣禄面带忧色，就问道：“什么事令你这样烦忧？”荣禄忧心忡忡地答道：“南海虽边远，但实在是一大都会。你到那儿任职，朝廷就无南顾之忧了。你此次出行将高举远引，跳出是非之圈，福诚无量。而我受恩至大，责任也最重。近日来，求生不能，求死不得，真不知该如何是好？”接着，荣禄把慈禧欲废黜光绪帝的谋划和盘托出，告诉李鸿章。李鸿章还未听完，便急切地高声说道：“此等大事，现在怎能这么做？试问你有几个头颅，敢于尝试此事？如果尝试，必定危险万状。各国驻京使臣，首先抗议。各省疆臣，更会有仗义声讨之举。你应该速去密陈太后，成败利钝，在此一举！”荣禄闻此言，怅然若失，感到非同小可，马上请求单独召见。
慈禧召见了荣禄，荣禄问：“传闻将有废帝之事，是吗？”慈禧反问道：“你认为废帝之事行吗？”这时并不同于朝堂之上、群臣之前，荣禄用不着拐弯抹角，他直率地说：“太后要行废立之事，谁敢说不行！但现在他的罪状还不充分，一旦废弃，难免会引起混乱。所以，奴才以为这件事不可不慎重！”荣禄的担心不是没有根据。自政变之后，舆论纷纷，人情汹汹。“皇帝有病，生命垂危”，甚至“要换皇帝”这类传说遍及全国。有的报纸还公开作了宣传。大臣们对废黜光绪的意见也不一致。有些大臣反对废帝，而有些大臣却极力策划废帝活动，如崇绮、徐桐等拟就请求废帝的奏疏后，曾拉最受西太后宠信的实权派官僚荣禄署名，准备让他领头搞联名奏请。但荣禄此人更有心计，他对内外的反应一直有所顾忌，尤其是惟恐惹怒列强以致不好收拾。因此，荣禄不愿在废帝的事上搞得过分露骨，对崇绮、徐桐的再三鼓励没有明确表态。荣禄看慈禧面有难色，于是献上了一条“妙计”：“现在皇帝年龄已大，一直没有皇子，不如选择宗室近友为大阿哥，当皇上的嗣子，兼嗣穆宗（同治帝），皇帝当年接任的诏书中已经讲了这层意思，别人不会说长道短。太后可把大阿哥弄来，养在宫中，慢慢用他来取代皇上，这不是名正言顺的事情吗？”
光绪二十五年（公元1900年）腊月二十四日，慈禧宣布以光绪帝名义颁发的立储诏书：立端王载漪之子溥仪为大阿哥。
