张角兄弟统率的黄巾军被东汉王朝镇压之后，黄巾军散布于全国各地的起义力量，又陆续进行了斗争，其中力量最为强大的是黑山、白波等黄巾军。经过的主要作战活动为：
黑山军与东汉围剿军的东光之战汉献帝初平二年（公元194年）十月，青州和徐州等地起义的黄巾军准备与黑山军会合，中途被军阀公孙瓒截击失败。接着曹操于汉献帝初平三年（公元192年）春，在东武阳地区战胜黑山军于毒、眭固等部。
黄巾军与东汉围剿军寿张、鹿肠山之战汉献帝初平三年（公元192年）夏四月，青州黄巾军以百万之众，正向兖州发动进攻。曹操率军经半年的残酷镇压，将这支黄巾军歼灭，以其中的精壮之士，编成了曹操的主力“青州军”。接着军阀袁绍于汉献帝初平四年（公元193年）夏六月，先后将黑山黄巾军的于毒、左兖、丈八、刘石、青牛角、黄龙、左校、郭大贤、李大目、于氏根等部一一歼灭。
黑山军的最后失败之战发生于汉献帝建安四年（公元199年）春。黑山军统帅张燕，率领10万大军为公孙瓒解围，被军阀袁绍击败，张燕最后投降了汉军。
五斗米道起义军抗击曹操围剿军之战发生于汉献帝建安二十年（公元215年）春三月，曹操亲率大军入巴、汉地区，进击张鲁起义军。起义军英勇作战，阻止了曹军的进攻。后来，曹军在撤退中，误入张鲁军营，引起起义军惊乱而被曹军击败，张鲁投降了曹操，五斗米道起义军彻底失败。
§§§第一节 黑山白波黄巾军的起义
一、黑山军的起义
自张角兄弟率领的黄军巾大起义被东汉王朝镇压后，各地的起义力量仍在继续战斗。在今河北、山西、河南活跃着许多支农民起义军。诸如黑山、黄龙、左校、白波、郭大贤、于氏根，青牛角、张白骑、刘石、左髭、丈八、平汉、大计、司隶、椽哉，雷公、浮云、飞燕、白雀、杨凤、于毒、五鹿、李大目、白绕、眭固，苦晒，等等。这些起义军多以起义首领的相貌特征为其名号，比如声音高者称为雷公，骑白马者称为白骑，行动轻捷者称为飞燕，多髭者称为于氏根。眼睛大者称为人目。其中势力大的有两三万人，小者也均有六七千人，总人数达到百万以上。
这些遍布山野的农民起义军，在各地起义之后，杀官吏，烧官府，砸监狱，劫府库，对东汉王朝的地方政权构成了严重的威胁。后来，他们在斗争中逐步联合，成为一支实力更加强大的起义队伍，称为黑山军。黑山军的首领最初为博陵人张牛角。
汉灵帝中平二年（公元185年）春，二月，张牛角、褚飞燕合军进击瘿（音影）陶（今河北宁晋西南），张牛角身中流矢而牺牲。张牛角在临牺牲前，命其部众以褚飞燕为帅，改姓张。这时，黑山军已达百万之众，声势浩大，东汉王朝无力镇压。张飞燕不久便派使者去京师洛阳，向汉灵帝上书表示降服。汉王朝拜张飞燕为平难中郎将。
张飞燕军的势力进一步向河内发展，逼近了京师洛阳，东汉王朝明封张飞燕为官，暗中却对起义军的发展十分恐惧，遂派朱儁为河内太守，率兵与起义军相抗衡。
二、白波等黄巾军的起义
汉灵帝中平五年（公元188年）二月，黄巾军余部郭大贤于河西白波谷（今山西襄汾永固镇一带）起义。称白波黄巾军，转战于太原、河东地区，力量逐渐发展至10多万人。董卓命中郎将牛辅率军前往镇压，被白波军击败。
当年六月，益州黄巾军在马相、赵祗率领下，于绵竹（今四川德阳）地区起义，杀益州刺史却俭。进击巴郡、犍为等郡县，旬月之间发展到数万多人，后来被州郡军和地方武装镇压下去。
§§§第二节 黑山黄巾军与东汉围剿军的东光之战
一、公孙瓒阻止青徐黄巾军与黑山军的会合
汉献帝初平二年（公元191年）十月，起于青州和徐州地区的黄巾军30多万人，在起义军领袖张铙等人的率领下，在大败北海相孔融之后，随之向勃海一带（约为今河北南部和山东北部）进军，准备与黑山军会合，进至东光（今河北东光）南。公孙瓒率领步骑兵2万多人，对青徐起义军进行突然袭击，黄巾军被公孙瓒击败，牺牲3万多人，军实辎重损失众多。
黄巾军战败，决定北渡黄河。公孙瓒又趁黄巾军正在渡河之机，半渡而击，黄巾军又受到很大损失，死者数万人，鲜血染红了河水，7万多人被公孙瓒军俘虏，车甲物资损失不可胜数。
公孙瓒因此次镇压黄巾军南胜利，“威名大震”，被拜为奋武将军，封为刨候。
二、曹操于簇阳和东武阳镇压黑山军的作战经过
汉献帝初平二年（公元191年）秋，七月，各地起兵的军阀盟主袁绍，与冀州牧韩馥占据冀州后，怀有鲸吞天下之志的曹操，想在黄河以南建立自己的地盘。这时，黑山黄巾军正在黄河以南地区发展起义力量，起义军将领于毒、白绕，眭固等，正率领10多万大军进攻东郡（今山东莘县南）、魏郡（今河北磁县南），东郡太守王肱无力抵抗。此时，做为袁绍部将的曹操率军进入东郡地区，于濮阳（今河南濮阳）与黄巾军展开激战，将白绕部击败，遂继任为东郡太守。
汉献帝初平三年（公元192年）春，曹操率军驻于顿丘（今河南清丰西南），黄巾军将领于毒，乘曹军北进之机，进攻东武阳（今山东莘县南）。
曹军诸将均认为应回军解救东武阳，曹操却坚持进攻于毒军的后方基地。曹操说：“孙膑救赵而攻魏，耿算欲走西安攻临菑，使贼闻我西而还，武阳自解也，不还，我能败其本屯，虏不能拔武阳必矣。”众将听罢，遂不再提异议，跟随曹操向西入山，围攻于毒军的山区根据地。于毒等未曾识破曹操“围魏救赵”的谋略。听说曹操率军进击其山区根据地，便急忙撤军回救。这样东武阳之围解除，曹操还乘机截击了睦固所部黄巾军。
§§§第三节 黑山黄巾军与东汉围剿军寿张、鹿肠山之战
一、曹操于寿张地区镇压黄巾军的作战经过
汉献帝初平三年（公元192年）夏，四月，青州（今山东省东北部）黄巾军，以百万之众进军兖州，攻城夺邑，斩任城相郑遂，继而向东平一带发展。
兖州刺史刘岱欲率兵迎击，济北相鲍信劝阻刘岱说：“今贼众百万，百姓皆震恐，土卒无斗志，不可敌也。观贼众群辈相随，军无辎重，唯以钞略为资。今不若畜士众之力，先为固守。彼欲战不得，攻又不能，其势必离散，后选精锐，据其要害，击之可破也。”甲刘岱轻视黄巾军的力量，率兵与黄巾军交战，黄巾军大胜刘岱军，将刘岱斩首。
鲍信见势不妙，便与州吏万潜等，至东郡向曹操秉报黄巾军的情况，迎曹操为兖州牧。于是，曹操便率军于寿张（今山东东平西南）与黄巾军大战，鲍信被黄巾军斩首。
曹军只有1000多人，开始与黄巾军接战，即被黄巾军击败，曹军死数百人，退回营内。
据《后汉书》引《魏书》记述说：“黄巾兵精勇悍，曹军新兵多，且未经过良好训练，战败之后，全军惊惧。曹操经过整顿，以重赏激励士卒，军队土气恢复，再与黄巾军战，将黄巾军战败。”双方经过六个月的多次作战，黄巾军到底不是悍将曹操的对手，终于败在曹操手下。
