木叶46年5月10日。琼海在暗部办公楼向战场的水门传递暗部截获的情报。此次行动由自来也在一面拖住土影，水门进行神无毗桥破坏行动。
当琼海看到情报中的神无毗之桥时便知道，宇智波斑要对带土动手了。琼海也有过考虑，到底要不要插手这件事。说实话，哪怕是风烛残年的斑，琼海也没有把握对付他。就算此时的斑把轮回眼给了长门，但是外道魔像在身边，还有一个不知深浅的黑绝。既然没有来招惹自己，那还是不要去接触的好。毕竟这虽然是带土黑化的原因，但也是他的机缘。
不是说琼海冷血，但这就是现实。如果是鼬的话，自家姐姐的孩子，自己的亲外甥，说什么琼海也会拼一把。这就好比一样被老虎追，老虎没追你追了别人，你松了一口气，至于能不能救他，自然量力而行。况且你知道老虎一定不会吃他，但是对于你就不一定的情况下。
宇智波一族确实不容易出现有带土这样性格的人。也难怪斑为了他煞费苦心，又是让白绝刺探情报，又伪装成岩忍诈死，将情报合理的交给木叶的暗部。就是因为一切太顺利了，顺利的琼海都不相信，才逆推出斑的做法。
琼海心想：且让斑先得意一阵子。木叶63年见分晓。至于带土，琼海只能说抱歉，日后想办法再来弥补吧。况且每个人都有自己的磨难，悲伤与仇恨确实能让人成长？琼海已经给他更好的生活，更高的起点，更幸运的童年了。哪怕是比较戴的儿子凯来说，琼海给的都一分不差。
事情按照历史的轨迹发展，水门摧毁了神无毗桥，为与土之国战争的胜利奠定了坚实的基础。这一天木叶出现了两个拥有写轮眼的英雄。宇智波带土，旗木卡卡西。带土的名字，深深的印在了慰灵碑上，同时也印在了卡卡西的心中。
在英雄们的葬礼上，有宇智波的族人提出了要回收带土赠与卡卡西的写轮眼。琼海听到他说的话后，气势一放，杀气弥漫。连同猿飞日斩，富岳水门等人都觉得背后一寒。
富岳自然表态：尊重带土的遗愿，写轮眼赠与旗木卡卡西。卡卡西，希望你保护好带土的眼睛，如果你认为你无法保护，那么宇智波一族自会回收写轮眼。
卡卡西立刻说道：谢谢富岳族长。
卡卡西心中对琼海十分感激，如果不是琼海力挺自己并且富岳表态，今天哪怕是老师水门也无法阻止宇智波回收写轮眼，就像白眼一样，写轮眼同样不允许非宇智波一族的人拥有，除非得到认可，不然必将倾一族之力进行回收。这是所有血继家族的潜规则，大家默认的东西。
富岳一直没有对琼海的实力有一个明确的认知，但是今天这一手，无疑让富岳对琼海的评价提升了数个档，起码自己也无法做到这样从容的震慑在场全部人。至于力挺琼海，一是琼海是自己的妻弟，并且两人的关系更像是兄弟。二是看在往日朔茂的情分上，照顾卡卡西的。
猿飞日斩心中一样惊骇：不知不觉琼海已经超越自己这么多了，可能比之前对战三代雷影时更强了。哪怕自己猿魔在手，估计也抵不过现在琼海了。更何况自己在一天天衰老，琼海还没有成长至巅峰。
此时琼海木叶第一强者的地位名至实归，再加上暗部总队长的职务在身，那几个顾问都对自己客客气气的，更不用说其余的人。葬礼只是战争时期的一个小插曲，卡卡西随后颓废了几个月，又开始振作了。雾忍方再次活跃，在土之国战败后，对木叶发起了新一轮的攻势。
短暂的休整之后，水门再次启程前往水之国战场。大蛇丸则是被猿飞日斩调回，明显这次大蛇丸做了冷板凳。不过大蛇丸也不在意，在团藏的资助与安排下，长期在死亡森林的地下实验室做研究。
另一面，带土在斑的救治下恢复了意识，当带土想要起身归队时，白绝细胞塑造的半个身体垮掉了。只得再次救治，并安心静养。在斑的安排下，从白绝口中听到一些外部的消息。就这样一面跟着斑学习忍术，一面修养并适应夹杂着白绝细胞的身体。
一年后，雾忍村宣布战败，波风水门荣耀归来，竞选第四代火影，卡卡西却失魂落魄整日颓废。琼海收到资料，雾忍的阴谋将野原琳体内封印了三尾，企图让她破坏木叶村，从而使得水之国前线木叶部队溃败。卡卡西带琳归来的途中遭到雾忍伏击，在抵抗时，琳撞在卡卡西的千鸟上身亡。
得到了消息的琼海顺便得到了一个小盒子，琼海心疼了带土一会便拿着盒子去找自己的老师大蛇丸去了。
大蛇丸老师，打扰了。
大蛇丸看见来的人是琼海，收起了被打扰的不愉快：是琼海啊，真是稀客，没在暗部，也没去竞选火影，来我这里做什么呢。
听到大蛇丸的挖苦琼海不在意：大蛇丸老师说笑了，我和你的志向都不在火影，所以自然是支持水门了，如果不是老头子非让我做暗部，我肯定更愿意做一个平民。
大蛇丸说道：这确实是你的风格，我也不是怪你没给我选火影投票，就像你说的一样，本来我就不在意火影这个位置，只是被后辈这样超越有点不爽而已。说吧有什么事情找我。
琼海掏出盒子递给大蛇丸：老师，帮我把这个做上防腐吧，日后我有用的地方。还有我看你最近研究的有些不符合要求，我倒是无所谓，就怕老头子找你麻烦。老头子在这方面眼里容不得沙子你也是知道的。团藏也不是什么好东西，必要的时候你也要考虑。
大蛇丸说道：好吧，你说的我也知道，但这同样是我的理想，你想要永生吗琼海，当然，现在你的力量已经超越我了，我同样对你的写轮眼和身体很感兴趣，要不要做我的实验体。
琼海摇摇头：算了，我暂时没兴趣，或许等我老的不行，会考虑的。
大蛇丸嘴上说着对琼海的眼睛和身体感兴趣，身体却没有行动。一是明知道自己实力不足，动手是愚蠢的，大蛇丸自认为对三代雷影只能逃，无法像琼海一样击杀。二是现在大蛇丸正值壮年，还没有更换身体，对写轮眼的渴求也没有那么严重。
答应帮琼海做的防腐，很快便做好了。这种小事情自然不要费多大功夫也容易的紧。对于自己这个弟子大蛇丸非常满意。力量超越了自来也的徒弟水门，超越了自己同样也超越了猿飞日斩成为木叶第一强者。自己虽然没有教导他多久，但依旧以老师相称，没有失礼。自己去摆脱他用职务便利帮助自己弄一些素材也没有拒绝。
对于琼海来说，大蛇丸相当于一个代课老师，对自己有着帮助，自己自然要记几分情谊。况且自己帮忙的都是不违反原则的小事情。哪怕就是日后大蛇丸判村，自然如此。自己的气量明显不止于木叶。
猿飞日斩为战争失利，主动辞去火影职位并担了大部分罪责。波风水门在木叶46年当选了第四代火影，这离不开猿飞日斩和琼海的支持，当然自来也出了不小的力气。团藏毫无意外再次落选，连他押宝的大蛇丸，也被水门淘汰。
同年，波风水门与漩涡玖辛奈大婚。木叶村的亲友与高层纷纷到场为其庆祝。琼海送了一套复式作为新婚礼物，玖辛奈收到了这样贵重的礼物自然非常开心。在这一年，琼海身边的朋友一个个也全部成了家。鹿久，丁座，亥一，犬冢花，志辉……
一到两年后，木叶十二小强将会陆续出生，距离木叶60年的剧情越来越近了。琼海心里也多了几分紧张。九尾之夜，宇智波灭族夜。一个个事情即将到来，到底该如何选择也没有决定。琼海的心越来越乱。
卡卡西依旧经常在慰灵碑发呆，时不时对着带土的名字诉说着发生的事情。偶尔还会痛苦说自己辜负了带土的期望，没有照顾好琳。带土也经常以神威方式在琳的墓碑前停留，或是暗中观望或是送上一束琳生前喜欢的花。
这一切都在琼海的感知之下，只是琼海不知道与他说什么好，索性就不见了。
木叶47年，富岳带着鼬在战场上历练。心存善良的鼬给重伤的敌村忍者水喝，却险些被杀死。鼬开始思考生命的起点，终点与意意。而后偶遇大蛇丸，在蛇叔的指点下有了自己的明悟。鼬也问过琼海，只是琼海不好回答具体。
美琴再次怀孕了。
