顶层组织：星区代表大会（又称“万人会议”）、星际条约协商会议（又称“千人大会”）；【各星区、星团、星系三级都设置有分会指导行政的管理。】
一级行政：宇宙共和常务委员会（9人执政）【常设一个辅政团体——90人议政局】
二级行政：科学委员会、军事委员会、安全委员会、星际学院、星际条约法务委员会、地厅系统（人工智能系统——“主机”）。
三级行政：科学委员会下属基础部、工程部、生命部、星体部、物理部、化学部、数学部；军事委员会下属步兵部、飞船部、空降部、通信部、控制部、军法部、高维度武器装备研究局；安全委员会下属地球安全部、地外安全部、飞船安全部、殖民地安全部、特殊安全部；星际学院下属寻星部、管理部、开发部、猎星局【实际直属于常务委员会，受科学委员会、军事委员会、安全委员会三重领导，星际学院只提供财政支持、不得干预该局行动。】；星际条约法务委员会下属地球法院、地外巡回法院、殖民地系统法院、立法管理部、最高法官联席会议；地厅系统下属监测系统、干预系统、服务系统。
四级行政：各部星区级别的机构，地球所在星区为第一星区。
五级行政：各部在星团的机构，地球在室女座超星系团、同星团的星系还有仙女座大星系、三角星系、大麦哲伦星系、小麦哲伦星系等189个星系。
六级行政：各部在星系群或在超大星系的机构，地球所在银河系为第一星系群又叫“本星系群”；直属常务委员会的特别计划序列，一般为定制型任务的临时组织【比如“神兵”计划、“猎星计划”（原来低级别）、‘超级装备’计划、“速度超越时间”计划、“终极大脑”计划，“秘密威胁”识别计划等等】。
七级行政：各部在星系或超大恒星系的机构，地球所在星系为第一星系既银河系；宇宙共和的星系舰队；物种管理跨部门合作组织。
八级行政：各部在恒星系的机构、各星系舰队支队、星际探索科考舰队。
九级行政：各部在行星的机构、恒星级战舰作为旗舰的任务型舰队、量子环控制台、量子隧道调控基地、特别任务太空基地。
十级行政：行星上的殖民地城市、卫星殖民地、研究基地、恒星级战舰、空间站。
十级以下由十级行政自行组织架构、自行任命并管理。
