在五笔字型汉字录入法中，字根是组成汉字的基本单位，能够区分各字根之间的细微差别，从而正确而且熟练地将汉字拆分为字根，无疑是掌握五笔字型汉字录入法的关键。在五笔字型字根总表中，有一些外形相似、但又有着本质不同的字根被分配在不同的键位上，初学者经常会将它们混淆，以至于得出错误的汉字编码，给五笔字型的使用带来困难。
为了方便读者学习，这里仅将易混淆字根中主要的几种列举出来，以供参考。在进行文字录入时，像这些形状相似但却不能同样处理的情况还有很多，只要按照所介绍的字形、笔顺等方法进行分析，相信读者就能够很快顺利得到答案。
（1）“七”和“匕”的区分
“七”和“匕”从字形上来看很像，而它们却不在一个键位上，这就会为包含这两个字根的汉字的拆分带来问题。
“诧”字和“此”字的最后一个字根虽然形似，但是如果从该字根的笔画书写顺序来区分，就可以进行判断了。“七”字是折起笔，而“匕”字是撇起笔，因而可以判断“诧”字拆分出的最后一个字根是“七”，其五笔编码为YPTA，而“此”字拆分出的最后一个字根是“匕”，其五笔编码为HXN。
（2）“戋”、“戈”和“弋”的区分
“戋”、“戈”和“弋”在外形上很相似，首笔笔画相同，都在同一分区中，但彼此所处键位号不同，使用时很容易混淆。在进行字根键位的判断上，可以按照每个字根第二笔的笔画来区分键位。
字根“戋”的次笔为横，因此在1区1位上：字根“戈”和“弋”的次笔为折，因此在1区5位上。如果将这三个字根应用到常用汉字中，可以看到，“饯”字中包含字根“戋”，根据以上的判断方法可以得到其五笔编码为QNGT；“伐”字中包含字根“戈”，其五笔编码为WAT；“代”字包含字根“弋”，其五笔编码为WAY。
（3）“勹”和“卩”的区分
“勹”和“卩”在有些时候很难分辨，当对汉字进行拆分时，应该注意它的同一性，然后按取大优先原则选取字根。
例如，“敖”字第二字根笔画为先撤后折，故可以认定它所包含的第二个字根为“勹”，其五笔编码为GQTY。“预”字的第二个字根笔画为先横折、后竖钩，与“阝”相似，因此按照取大优先的原则，认定它所包含的第二个字根为“卩”的变体，其五笔编码为CBDM。
（4）且字头“目”和具字头“且”的区分
且字头“目”和具字头“且”经常被初学者混淆，很多读者都分不清应该将具体的汉字拆分成哪一种字根比较合适。可以看到，且字头“H”中有两横，它是字根“月”的变形字根，与月在同一个键位。而具字头“且”中有三横，这是它与“目”的本质区别，因此很多初学者将它分解为“目”和“一”两个字根是错误的。
例如，“悬”字的首字根是“且”，所以应该选择字根“月”所在的键位，它的五笔编码为EGCN；而“具”字的第一个字根是“且”，它的五笔编码为HWU。
（5）斜勾部分起笔先后笔画的区分
“尧”、“曳”和“戊”等字中虽然都包含有看起来相似的成分，但是由于其中所包含的斜勾部分起笔的先后笔画不同，所以在进行汉字拆分时，对应所选择的字根也不同。
“尧”字的斜勾部分由横、斜勾和撇组成。虽然字根“戈”与该字的上半部分相似，但是却多了一点，因此不能选择。由于“戈”与字根“七”相似，按取大优先原则，可以选取“七”的变体字根“弋”为该部分字根，即“弋、丿、一、儿”，其五笔编码为ATGQ。
“曳”字中也含有斜勾部分，它是由斜勾和撇组成的，即“乙、丿”，与字根“匕”相似。按照取大优先原则，取“匕”的变体字根作为该部分字根，拆上弦月分为“日、匕、丿”，其五笔编码为JXE。
“戊”字中的斜勾撇部分由于末笔为“丶”，因此不能取字根“七”或“匕”的变体，只能取“乙”作为它的字根组成部分，拆分为“厂、乙、丿、丶”，其五笔编码为DNYT。
