○14《日本未详所藏者敦煌写经目录》，著录105号；
○15《其他》（散藏目录），156号；
○16《欣赏篇》，列目180号。
以上，去除重复，共著录敦煌遗书26900多卷。是著录最多的一部敦煌遗书总目，对旧拟名卷子拟名不当者作了不少订正，对不少无名卷子给出了定名，同时，又从旧编号中析分出不少子目，这些都是本书优胜之处。但此书收录仍多有遗漏，如俄罗斯藏敦煌遗书，今知编号已达18,943号，黄氏《最新目录》只著录孟列夫已刊布的2954号，不及俄藏的1∕8。此外，本书只著录卷号、卷名，其它要项如首题、尾题、纸幅、尺寸，行数、整残、书法、年代、人名、题款、解题等一概阙如，提供的信息量有限，使用价值不能不大打折扣。
3.《敦煌遗书总目索引新编》，此书由敦煌研究院文献研究所施萍婷研究员主编，邰惠莉副研究员助编。北京中华书局2000年7月出版。早在20世纪80年代，敦煌研究院敦煌文献研究所的前身、原敦煌文物研究所敦煌遗书研究室的同仁，在阅读中、英、法藏敦煌遗书缩微胶卷时，常常发现《敦煌遗书总目索引》中的某些错误或不足，乃在一本本所公用的商务印书馆旧版《敦煌遗书总目索引》上隨手批注，或径作改正、补缺，这本公用的《敦煌遗书总目索引》布满诸人手书及钢笔、蘸水钢笔、铅笔、圆珠笔甚至毛笔书迹，为后来从事《敦煌遗书总目索引新编》的编写工作做了某些先行性准备。上世纪80年代末期，施萍婷先生申请《敦煌遗书总目索引新编》项目，得到研究院学术委员会批准，此项工作于是转为施萍婷先生个人项目。经过施先生十多年的努力，终于在2000年出版问世。此书对《敦煌遗书总目索引》作了进一步的订正和增补，改正了某些卷子错误的定名，纠正了某些题记及释文中的误字，吸收了近年某些研究成果，尤其是为不少卷号增补了漏载的子目，如P.2680号，《敦煌遗书总目索引》著录云：“高僧传赞等”，所作“说明”仅谓：“其中有世亲无著、刘萨诃、义净等。背有杂物账及《声闻唱道文》等。”而《敦煌遗书总目索引新编》则将卷子正面著录为17目，背面析分为9目，如实反映了该卷的内容，大大补充了未曾著录的内容，提高了该卷的文献价值。
但此书也存在不少缺憾。如：
1.沿袭旧误，未加改正。如《敦煌遗书总目索引·北京图书馆藏敦煌遗书简目》著录洪字62号为《杂说如来本行》，《新编》作《杂记如来本行》。实则为壁画榜题底稿；《敦煌遗书总目索引·斯坦因劫经录》0087号《金刚般若波罗蜜经》题记中的“大斗拔谷”，误录作“大升拔谷”， 《新编》仍沿其误。
S.0646a，《敦煌遗书总目索引·斯坦因劫经录》著录为《佛经》。实为僧神秀之《观心论》。《新编》一仍其旧。
S.3287（2）《敦煌遗书总目索引·斯坦因劫经录》拟名为《王羲之书论》，“说明”中云“字不可识。”愚按，“ ”即“皤”别体，见《说文解字·白部》。时因催促出版，编者不及细审，容有小疏。而《新编》于50年后仍云“字不可识”，似难取谅于人矣。
S.3303《大乘无量寿经》题记“张谦逸写”。按张谦逸为张议潮之父（见P.3556《周故南阳郡娘子张氏墓铭并序》），本卷赖有此题名，则价值大增。《敦煌遗书总目索引·斯坦因劫经录》误作“张谦益写”，“ 逸” “ 益”一字之误，使本卷价值大减。《新编》仍作“张谦益写”，颇疑《新编》编者未查对原卷照片。
S.4281，《敦煌遗书总目索引·斯坦因劫经录》著录为《道经》。实则为唐玄宗御撰《故金紫光禄大夫鸿胪卿越国公景龙观主赠越州都督叶尊师碑铭并序》（见《全唐文》卷四十一）。《新编》亦沿其误。
S.5508《敦煌遗书总目索引·斯坦因劫经录》著录为《大乘律二十六部五十四卷五秩大乘律音义第二》。实为后晋可洪《新集藏经音义隨函录》，此名，既确定了该卷究竟所属，且关系着该卷之校勘及定年。而《新编》一仍旧误。
S.5888，《敦煌遗书总目索引·斯坦因劫经录》拟名为《书仪》。此卷实为《记室备要》。而《新编》迳名《书仪》。
S.6311v，《敦煌遗书总目索引·斯坦因劫经录》拟名为《字书断片》，《新编》一仍其旧。实为《玉篇》断片。
P.3807《敦煌遗书总目索引·伯希和劫经录》拟名为《大唐内典录卷第八》，《新编》一仍其旧。实为《吐蕃统治末期沙州龙兴寺藏经点检勘目录》
2.某些卷子拟名，让人啼笑皆非。如S.3198v，《新编》拟名为《翁家梁某向新妇孙儿问安帖》。公公“向新妇孙儿问安”，岂有是理？
3.某些写卷内容非一，当分号列出，而《新编》仍有遗漏，未列细目。如S.361vb，《新编》仅云：“杂写数行。”而实为《长信草》（崔辅国作）、《三月三日泛龙舟诗》及《曲子名》（隋煬帝作）各一首。
4.不同卷子业经缀合者当加说明而未加说明。如S.4277，朱凤玉早在1987年已指出为俄藏L.1456之前半，两者可缀合。《新编》未予说明；
S.2565可与P3024缀合，《新编》亦未说明；
5.说明有误。如S.3180v《请僧疏》，《新编》“说明”云“仅存三行，乃于阗国之物，后作为裱褙纸用。”按，此件为沙州归义军官衙延请沙州僧尼为于阗王逝世百日追念设供之请疏，今存六行。其事虽关乎于阗国，而写本却非“于阗国之物”，亦不“仅存三行”；
P.2354《投金龙玉壁〔璧〕仪》，《新编》“说明”云：“黄永武定名。”实则为大渊忍尔所定名。
6.目录正文著录之卷名，与索引著录之卷名互不相应。《新编》之《伯希和劫经录》P.3539v著录为《残牒及乐谱两行》，“说明”云：“关于两行乐谱，何昌林定名为‘二十谱字表’”。《新编》之索引第54页何字部，作“何昌林《十二字谱表》 P.3539v”。两处著录的卷名不同，互不相应，徒自乱章法。
8.错字、脱漏字及增字、衍文，其例颇多，不烦枚举。
作为应用目录，第一要求是可信可凭，《敦煌遗书总目索引新编》疏率如此，今人遗憾，亟需加工修订。
第四种关于某一种类别或某一专题系列的学术性目录。例如：
1、[日]三木荣编《西域出土医药关系文献复合解说目录》，刊《东洋学报》四十七卷一期，1964年。本目汇集英法所藏敦煌吐鲁番文献中的医药文献及同医药有关的文献，为敦煌医药研究提供系列资料。
2.敦煌石室经卷中未入藏经论著述目录
3.敦煌所出古逸经疑似经目录
4.敦煌变文残卷目录
5.敦煌曲子词残卷目录
6.敦煌四部遗书目录
以上2－6目，皆收入王重民等编《敦煌遗书总目索引》
7.《西域出土汉文文献分类目录Ⅲ（斯坦因将来大英博物馆藏敦煌文献分类目录、道教之部）》，吉冈义丰编，1969年3月印行。收录英藏敦煌道教经卷及道教文书。
8.《西域出土汉文文献分类目录IV（敦煌出土汉文文学文献分类目录附解说斯坦因伯希和本）》，金照光编，１９７１年３月印行。收录英、法及中国所藏敦煌文学文献。
9.[法]拉露：《巴黎国家图书馆所藏敦煌藏文写本目录》三卷（Inventa：re des manuscripts tibetains de Touen-huang,conserves a la Bibliothèque Nationale Ⅰ［No.1-849］1939，Ⅱ［No. 850-1282］1950，Ⅲ［No. 1283-2216］1961），分别于1939、1950、1961年出版，共收入法藏敦煌藏文文献2216号。
10.[日]大渊忍尔：《敦煌道经·目录编》，日本福武书店，1978年出版。
11.刘屹《<敦煌道经·目录编>补遗》，见《北京图书馆馆刊》，1999年第3期。
12.王卡《敦煌道教文献编号索引》，收入王卡著《敦煌道教文献研究――综述·目录·索引》，北京中国社会科学出版社，2004年10月出版。
13.［比］瓦累·普散（Louis de la Vallée Poussin 1869-1937）：《（英国）印度事务部图书馆藏敦煌藏文写本手卷目录：附榎一雄补汉文目录》（Louis de la Vallée Poussin：Catalogue of the Tibetan Manuscripts by Kazuo Enoki，1962），1962年出版，共765个编号。
14.韦列（ A.D.Waley）:《斯坦因敦煌所得绘画目录》（A Catalogue of Paintings Recovered from Tunhuang by sir Aurel Stein）,1931年出版。著录斯坦因挈往英国的敦煌吐鲁番等地绘画约500号。
15.山口瑞凤：《斯坦因搜集西藏语文献解题目录》，从1977年到1984年已出八个分册。
16.王尧主编：《法藏敦煌藏文文献解题目录》，北京民族出版社，1999年2月第1版。此目除对拉露编《巴黎国家图书藏敦煌古藏文写本目录》所著录的2216号吐蕃文写卷逐一加以描述、解题之外，并对拉露目录漏收的法藏散卷中的50件吐蕃文写本及绘图进行了增补。
17.田中良昭编《敦煌禅定资料分类目录初稿》，见《驹泽大学佛教学部研究纪要》之27、29、32、34各期（1969-1976）。
18.兜木正亨编《斯坦因伯希和敦煌收集品中法华经目录》，1978年出版。
19.张广达、荣新江：《巴黎国立图书馆所藏敦煌于阗语写卷目录初稿》。刊北京大学历史系中国中古史研究中心编《敦煌吐鲁番文献研究论集》第四辑，1987年4月。
