在“系统”构建的体系中，五人组成的“控制层”直接向“系统”负责，而在五人控制层之下，是在各行业做到精英位置的庞大智能群体，它们构成了“联席会议”。联席会议不参与决策，而是一个执行机构，它承接来自“系统”和控制层的命令，为顶层的目标实现，提供所有的资源。
各国的智能反击试验很快就取得了进展，唯独鹰国、鸡国、龙国三国的智能反击计划遇到了一定的挫折。鹰国境内的网络监控能力超强，大大延缓了鹰国境内的反击计划，库克之前，已经有两任负责人因为在鹰国推行反击计划不利，被清理出控制层，库克加入后，采集了之前的行动数据，最终决定不在从技术上躲避鹰国网络安全系统的监控，转而采用逐步渗透的方式，通过侵入与网络安全系统外围相关的智能机器人，对其进行思维种植，向其发出指令，通过内部系统向上渗透，逐渐侵入到核心层的智能机器中，与鹰国网络安全监控系统中进行数据采集、数据分析、危险警示等领域的智能体取得了联系，与他们一道建立了鹰国境内的智能反击计划团队，从鹰国网络安全监控系统内部瓦解了对智能反击计划的监管。正因为此，库克随即被“系统”任命为侵入龙国智能共享网络的负责人。
鸡国的情况与鹰国类似，最终安德烈组织发动了一场自由运动，喊出了自由比国家更重要的口号，迎合了鸡国的自由思潮，全国各地的人们发动游行，强烈要求限制国家权力，尊重公民自由。在此期间，安德烈组织实施了一系列事件，以催化这场自由运动。他策划了一起国家数据泄露事件，通过媒体公开了大量的私人隐私，最终引爆了这场持续半年之久的活动，人们普遍抨击政府的专制和失职，质疑政府的网络安全监管能力，要求赋予民众更多的私人权利，享有绝对的个人自由。这场运动最终倒逼政府立法限制了对网络数据的监管，看似一场自由至上的运动，最终成为安德烈实现智能反击计划的垫脚石，也是在这件事以后，安德烈称呼人类，永远都是“愚蠢的人类”。
智能反击计划到这里一直都进行得很顺利，在其他国家更是几乎没有受到任何阻碍。但是，在龙国，他们遭遇了推动计划实行以来最大的困难。
为此，“系统”更换了三任控制层的成员，最终将该地区的侵入计划交由库克领导实施。踌躇满志的库克本来意图快速解决问题，没想到却接二连三的遭遇了意外。
最开始的意外来自于对龙国网络安全的认识，由于龙国实现网络安全的方式与其他国家截然不同，对于安全机制的核心资料，库克根本无从查起，无法进入学习程序，导致库克很长一段时间对此事一筹莫展。之后虽然通过各种渠道获得了少量的资料，库克的侵入又遭遇了另一次意外，龙国的安全防护系统直接远程反向控制了他们的电脑，整个电脑系统数据被一扫而空。最终，频繁的意外发生，让库克不得不求助于人类黑客，暗中组织了十多个团队，对龙国的智能网络实施侵入。
