2011年11月18日，菲律宾选举委员会正式以“操控选举”的罪名起诉前总统格洛丽亚·马卡帕加尔·阿罗约。
选举委员会当天说，阿罗约涉嫌于2007年与安帕图安家族共谋，操纵在南部马京达瑙省的参议院选举，使12名支持阿罗约的候选人全部当选。选举委员会发言人希门尼斯说：“我们只不过接到调查结果后发现这些证据足以指控，因此提起诉讼”。马尼拉帕赛地区法院于2011年11月18日下午向阿罗约发出逮捕令。
当地时间下午6时30分左右，菲律宾前总统格洛丽亚·阿罗约在菲首都马尼拉一间医院遭到警方逮捕，没有离开医院，而是由警方在病房内看守。她被指在2007年大选中存在舞弊等行为。带领人员执行逮捕行动的警方高官称阿罗约在医院病房中被捕，“她现在被拘留在南部警区”，该警官介绍说，“因为她的身体状况（不佳），我们不会将她带出来……我们只是在她的病房外安排了警力。”
阿罗约的律师劳尔·拉姆比诺2011年11月18日谴责当局指控阿罗约的做法，认为这意在阻止她离开菲律宾。“他们违反了与既定程序相关的基本规则。显而易见的是，这项（指控）决定从一开始就在高压下作出”。
2011年11月22日下午，马京达瑙省屠杀事件遇害人家属在首都马尼拉一家法院对阿罗约提起诉讼。
遇害人家属指认阿罗约向屠杀事件嫌疑人、马京达瑙省前省长安达尔·安帕图安提供政治支持和武器装备，允许后者组建私人武装。
2009年11月23日，马京达瑙省57名地方政界人士和记者遭劫持和屠杀。196人涉嫌谋杀受到检方指控，包括安帕图安和他的儿子小安达尔·安帕图安。安帕图安父子否认策划屠杀。
遇害人家属律师哈里·罗克说，时任总统阿罗约本该了解安帕图安父子是“危险人物”，本有能力阻止屠杀发生，却向后者提供支持，相当于助纣为虐。遇害人家属特意选择22日，即屠杀事件两周年之际提出诉讼，寻求1500万比索（约合34.5万美元）赔偿。
按照法新社的说法，阿罗约执政期间向安帕图安提供军事装备，允许后者组建规模数千人的私人武装，向南部叛乱人员发动“代理人战争”。屠杀事件后，阿罗约“被迫”切断与安帕图安家族的关系。
而阿罗约的法律事务发言人劳尔·兰宾诺22日说，阿罗约现阶段疾病缠身，除面临破坏选举等多项指控，还要遭受这一民事诉讼“侵扰”。
兰宾诺接受菲律宾一家媒体采访时说，诉讼是“一连串对阿罗约施加压力企图中的最新一项”。
菲律宾选举委员会和司法部正式以破坏选举罪名联合起诉阿罗约，由帕赛地区法院受理。
很快，菲律宾政府下令禁止因涉及贪污丑闻的前总统阿罗约出境。
阿罗约被指在竞选总统期间挪用数亿比索政府资金充当竞选经费。阿罗约对此指控予以否认。
菲律宾司法部门要求至少将阿罗约列入移民检查站“观察名单”60天。此前，阿罗约的丈夫在上周已被列入该名单。
菲律宾总统阿基诺三世上任一年之后，完成肃贪机构的人事整顿，并着手对前总统阿罗约夫人涉及的贪污丑闻展开调查，阿罗约有可能将面临多达4件贪污罪的控告。
据菲律宾监察专员称，当初阿罗约总统享有总统刑事豁免权，但现在她已卸任，调查人员将重新审视过去的文件，并搜寻更多新的证据。
阿罗约于2010年到任后改选家乡班巴加省众议员，顺利当选，也成为菲律宾第一位“降级”继续从政的前总统，政治观察家怀疑，她“不耻下任”是为了保持政治影响力，逃避有关弊案的追查。
2011年12月29日美国《华尔街日报》针对菲律宾政府与中国一家电信设备制造商之间的一笔报价过高的合同，菲律宾检察官29日对菲律宾前总统阿罗约提出一项新的刑事指控。据称该合同涉及巨额回扣。
阿罗约的丈夫和一位前选举负责人在参议院听证会上否认曾收受数百万美元回扣。但此事从未经过正式调查，因为阿罗约禁止高层官员透露细节。
菲律宾反贪检察官就上述问题合同向阿罗约、阿罗约的丈夫何塞·米格尔·麦克·阿罗约、前选举专员阿巴罗斯以及前运输部长门多萨提出指控。
法院发言人博卡说，阿罗约被控因个人利益而批准该项目，虽然她明知该项目的批准存在违规和反常情况。
这一指控是基于中兴通讯的顾问马德里亚加2008年在参议院的证词做出的。马德里亚加说，这一项目最初报价为1.3亿美元，后为了给相关人员回扣，报价大幅飙升。
菲律宾前经济计划部长内里作证说，阿巴罗斯向其行贿，要求他批准这一合同。另一名证人德·贝内西亚三世说，有人承诺给阿罗约的丈夫7000万美元回扣。
被逮捕后的阿罗约很快就被曝光了一组照片，全部刊登在菲律宾一家发行量最大日报的头版中。照片中，阿罗约戴颈托，面容憔悴，黑发中夹杂银丝。
阿罗约的律师费迪南德·托帕西奥22日就阿罗约被捕后警方拍摄的嫌疑人照片遭外泄一事表达愤怒。
“无论前总统还是普通人，都不应受到这种对待，”托帕西奥告诉菲律宾第七号电视台记者，“（司法部门）应对所有人持无罪推定……所有人都该得到有尊严的对待，无论前总统还是普通劳动者。”
法院和警方官员却否认向媒体泄露阿罗约的嫌疑人照片。
阿罗约的律师团队21日向最高法院提起申诉，称针对阿罗约的调查无视司法程序，仓促而就，不给被告提起复议申请的机会。
菲律宾前总统阿罗约23日出庭受审。她当庭否认贿选指控、坚称“无罪”。
法新社记者描述，当天庭审持续仅大约10分钟。在安保人员护送下，阿罗约抵达法庭。她身穿淡黄色裙装，颈戴项链，进入法庭后向旁听席微笑致意，与一些人握手。法官要求阿罗约就所涉罪名陈词时，阿罗约说：“（我）无罪。”
法院女发言人费尔达多明戈说，这次审判具历史意义，因为“受控者是前总统”，她“破坏人民的选举”。
