战争结束，裁军是势所必然的。因为当时军队之多。军费之大，政府财政已完全不能承受，占到了全部开支的80%。而纵观民国以来，各派争雄，皆军队而起。
蒋把杨永泰、方本仁、吴礼卿请来，对他们说：“天下初定，当务之急是筹划安邦定国大计，不知各位有何见教？”
杨永泰早已胸有成竹，当即侃侃而谈：“如今虽天下将定，然各派军事势力，仍各霸一方。阎伯川、冯焕章、李德邻、李任潮、张汉卿，还有那个小皇帝，都不可小瞧。我觉得为今之计，莫如把他们调到中枢来任职，使他们脱离老巢，削其兵权，然后取消各地政治分会，强化中央集权。”
蒋介石听了，点点头，表示认可。
吴礼卿忙献计：“总司令当整编军队，遣散各实力派赖以争雄的资本。这样，国家就会安定了。”
蒋介石眉头一皱：“裁军是最敏感的事，如何做好？”
方本仁说道：“介公要把党权、军权全部抓到手，需要再来个辞职通电。”方本仁接着告诉了辞职的妙用。
蒋介石一听，转惊为喜：“先生所言极是。”
不久，蒋介石通电辞去国民革命军总司令及军事委员会主席职务。通电称：伏查中央执行委员会第四次全体会议，制定的国民革命军总司令部组织大纲第一条，国民政府为国家战时军令之统一，特任命国民革命军总司令1人。是作战目的完成之时，即总司令职权当然解除之日。中正本年2月复职之电，亦经剀切陈明，一俟北伐完成，即当正式辞职，以谢去年弃职引退之罪。息壤在彼，尤蒙昭鉴。为此沥陈缘由，恳予明令府准，将国民革命军总司令职权解除，并准辞去军事委员会主席。
蒋介石的通电目的有三：第一、主动辞去期限将到的总司令职，以免闲言碎语，飞短流长。反而会赢得美名，而权力不会解除。第二、要裁军削藩，只有从我作起，辞去军职，方能收到奇效。第三、以辞职来识别真假拥护自己之人。
接着蒋介石的亲信们也纷纷辞职。一时间，在南京政府军政要员中刮起了一股辞职之风。
紧接着，冯玉祥坐不住了，他知道目前国民党中不能没有蒋介石的支撑。他虽然对蒋不委任他为接收京津大员而耿耿于怀，但为自己的利益计，发出了挽蒋通电。
南京政府及中央党部分别发出挽留通电。阎锡山、白崇禧、李宗仁、何应钦、李济深分别发出挽留通电。可是挽留的呼声越高，蒋介石的去意愈坚。
蒋介石向国民政府请假一周，偕宋美龄畅游金山寺，又顺江到达上海，转道回奉化省亲。表现了一种少有的闲情逸致。在一片恳请挽留声中，蒋介石于是声言，他已打消辞意，仍将对军事负责到底。
接着，蒋介石抛出了裁军计策，企图削弱其它几派的兵权，以建立并强化他所代表的中央集权。
国民党的要员在碧云寺旁李石曾住宅开谈话会。蒋介石抛出了《军事善后案》，说道：“北伐成功，军队要缩减，当今革命最要紧的是裁兵。裁兵就要服从中央统一号令。”《军事善后案》中，蒋介石要把全国军队的300个师，裁汰250个师，余50个师。每师15000人，全国共80万人。全国分12个军区，每军区按比例保留军队。
冯玉祥立即开言：“裁兵，我同意，但必须有个前提，就是枪支不全者裁，老弱不堪者裁，纪律不佳者裁，训练太缺者裁！这样，兵员虽少，但精而强，可保卫国家。否则，把别人军队裁掉，把自己军队留着，这太不公平嘛！”
阎锡山接着说：“焕章兄说得对呀！裁兵当先立合理原则，然后从长计议。”
李宗仁也说：“冯总司令之言，我深表赞同，具体裁法，还当商量。”
蒋介石见这个意见通不过，就说：“焕章兄说得也在理，散会后大家再议一议，拿出妥当方案，切实解决裁兵问题。”
接下来，蒋介石又开始了“削蕃”政策，欲把权力集中到南京，把一些军阀们都集中到南京任职，但除了冯玉祥外，却没人响应。
随后，为因为裁军的事情开了几次会议，但各个军阀都吵得不可开交，往往不欢而散，而没有实际进展。
终于商议，蒋介石最后确定：全国共设9个编遣区，中央直属各军编遣区、海军编遣区、第一编遣区由蒋介石直接管辖，办事处设在南京。第二编遣区属西北军，办事处设在开封。第三编遣区属晋军，办事处设在太原。第四编遣区属桂军，办事处设在汉口。第五编遣区属东北军，办事处设在沈阳，第六编遣区属蒙古军，办事处设在承德。另划一个第七编遣区，编遣云、贵、川、康各处军队。这样一来，连第七编遣区在内，蒋介石能控制四个编遣区。东北编遣区和蒙古编遣军是蒋提出来的，张学良和溥仪也很感激他。
会议开到这个时候，冯、李、阎才顿时醒悟，自觉他们上了蒋介石的圈套。阎锡山、李宗仁一时间成了哑吧，采取消极抵抗态度。冯玉祥在恼怒中提出动议：“现在刚刚打完仗，不是编遣的时候，应当先休整一个时期再编遣。”
冯玉祥的动议一提，赢得一片赞同声。蒋介石眼见一时难以使各派实力派就范，只得同意暂时不编遣。
蒋介石企图利用编遣军队的办法来达到削弱和消灭异己，扩充自己力量的目的，最后不仅没有达到，反而激化了各派新军阀与蒋介石所代表的中央的矛盾。
于是后来，蒋介石又想到了一招“逐个分化打击”的办法，先对李宗仁对手了。
他暗中拉拢被白崇禧赶走的唐生智，到白崇禧那里拉拢自己的旧部反白，并把白崇禧赶到香港。
一场蒋李战争就要爆发了。
蒋介石利用桂唐的矛盾，不动一兵，就把河北的10万桂军改编为拥蒋部队。立唐倒白是对桂系作战的第一步计划完全实现了。
蒋介石瓦解桂系的第二步计划，是诱骗李济深北上，分化粤系。拆散粤桂联盟，孤立桂系的老巢广西，使李、白无后退之路。
李济深到达上海后，面见李宗仁协商处理湘案办法。李宗仁劝他不要去南京，怕遭到不测。李济深为此思想反复，请蔡元培等人转告蒋介石，借口因身体不好，暂时不准备去南京。
蒋介石调李济深去南京，是拆散粤桂联盟的关键。因此，催促蔡元培、吴稚晖、李石曾、张静江四人，一定要把李济深请到南京来。
于是蔡元培等四人向李济深担保绝对安全。这样，李济深在蔡元培等四人的陪同下，于3月12日到了南京。李济深一到南京，便被蒋介石的人看管起来了。
李宗仁自然不愿意，立即就发布通电，宣布倒蒋。
因为这个导火索，蒋李战争终于打了起来。
蒋介石发布讨伐桂系作战令。次日，国民党第三次全国代表大会做出开除李宗仁等人党籍的决议。并于次日查抄了李宗仁在南京的住宅。并亲赴前线指挥作战。
在蒋桂战争爆发前后，各实力派也都在打自己的盘算。
阎锡山发表通电，响应蒋介石的讨伐令。
同日，四川的刘湘也声明助蒋讨桂。并说明四川境内的桂军由他负责。实际是防止蒋介石，以追击四川境内桂军为名进入四川。
冯玉祥则采取两边应付的办法，企图从中渔利。一面答应蒋介石出兵讨桂，一面继续与桂系暗中联系，答应到时助桂反蒋。为了便于他的部队从中取利，冯玉祥派韩复榘屯兵信阳，派石友三率部屯驻襄樊，孙良诚部进驻徐州。同时，冯玉祥印制了大批讨逆布告，但不印所讨之逆为何人，只印“贪脏枉法，横征暴敛，屠杀民众，迫害青年”之类的罪名。他的用意是，如桂系失败，即令韩、石两部直驱武汉，布告上填写“讨桂”二字，先于蒋介石占领武汉，夺取湖北；如果蒋失败，孙良诚从徐州出兵浦口，贴出讨蒋布告，先于桂系进入南京。
究竟蒋李战争谁是最终的胜利者呢？
