拥有了自己队伍的朱元璋，紧接着打下滁州这座名城作为根据地。在此期间，许多人慕名来投，这些人后来成为了大明开国的股肱之臣。然而，内乱不止，外患又至，滁州城又陷入到重重危机之中。
人才荟萃
朱元璋收编了驴牌寨、横涧山和冯氏兄弟这三支队伍之后，加紧练兵，建立严明的军纪，使这支三万人的部队的战斗力得到了很大的提高。为了站稳脚跟，寻求一处稳定的根据地，接下来最大的任务，就是南下攻取滁州。
在朱元璋的大军开往滁州的路上，定远人李善长主动求见。李善长是个智谋超群的人，善观时局。初次交谈，朱元璋就有种相见恨晚的感觉。李善长以汉高祖刘邦为例，称赞平民出身的汉高祖气度不凡、目光高远、善用人才。末了一句“公濠产，距沛（汉高祖刘邦家乡）不远”，更是让同是平民出身的朱元璋萌生出了称霸天下的野心。从此，朱元璋常常拿自己和汉高祖作比较，视李善长为心腹。
滁州城地势险要，是一块易守难攻的要害之地。朱元璋的大军来到滁州城下，却发现在这里守城的元军的力量极为单薄，黑将军花云一个人带队冲锋就占领了这座名城。
攻下滁州后，朱元璋的侄子朱文正来投，姐夫李贞也带着外甥保儿（后改名文忠）来到滁州。定远人沐英，父母在战乱时死去，孤苦无依。为笼络人心、培养心腹，朱元璋将保儿、沐英收为义子，改姓朱。
在此期间，虹县人邓愈率部来投，虹县人胡大海也带着全家来投。胡大海祖籍波斯，祖辈随着蒙古大军来到中土，到他这一辈成了炸油条的小商贩。此人不但身材魁梧，勇力过人，而且很有见识。虽然他不识字，却知道礼贤下士，曾多次举荐大贤，如刘基、宋濂、叶琛、章溢等人。他的出现，为朱元璋宏图霸业的发展，起了很大的作用。
滁州之危
在朱元璋攻下滁州的这段时间，濠州城发生了很大的变化。自称鲁淮王的彭大，与自称永义王的赵均用率领红巾军主力，攻下盱眙泗州。他们两个平时就因为郭子兴和孙德崖的问题不和，这次干脆闹翻了脸。赵均用和孙德崖在内的四帅是一派，彭大和郭子兴是一派。由于部队实力上的差距，双方争斗的结果很明显。最后彭大不是他们的对手，手下得力的人也被他们一个个收买过去，他一时气闷不过，竟发病死了。
彭大一死，郭子兴的处境更加艰难，孙德崖几次想借题发挥，置他于死地，想到屯兵几万的朱元璋就在不远的滁州，只好暂时作罢。不多久，他们又想出了个斩草除根的毒计，下令调朱元璋回来守盱眙。朱元璋心里很明白，于是假称部队暂时调动不开，同时又用钱收买了赵均用府上的人，并不时地劝赵均用，不要听了小人的挑拨，削减自家队伍的实力，万一内讧起来，对大家都没有好处。赵均用思来想去，终于决定放过郭子兴，让他带着原有的一万多人马去滁州。朱元璋怕郭子兴多心，不但交了帅位，就连兵权也交给了他。郭子兴十分高兴。
至正十四年（1354）十一月，元丞相脱脱统兵在高邮大败张士诚，之后分兵围了六合，六合主将向郭子兴求救。此地处于滁州东侧，一旦失守，下一个目标肯定就是滁州。但是郭子兴与六合主将有仇，不肯出兵，朱元璋一番苦劝，讲明要保滁州必救六合的道理后，这才带了一队人马去救六合。元兵号称百万，除了滁州城的援军，再没有谁敢来救援。在元军猛烈的攻势下，眼看着坚持不了几天，朱元璋只好掩护着六合的百姓提早撤往滁州。
哪知百姓刚刚撤离出城，守城军心便散了，六合城当下失守。元军乘势追击，却误中朱元璋在途中设的埋伏，延缓了进攻的速度。即使朱元璋全军成功退进了滁州，可滁州孤城无援，元军重重包围，早晚难逃一死。在没有任何解围办法的情况下，朱元璋只好忍气吞声，准备了牛肉和好酒，又将缴获的战马送还元军，苦苦哀求，说城里全是普通的百姓，不敢造反，组织起来只为自卫，并表明情愿为大军提供军需给养。元军也不愿多作无谓的死伤，再加上又得了好处，这才移兵他地，滁州算是保住了。
