废水是污染环境的重要材料之一，它主要含大量有机物质，其中主要成份之一是纤维素，如果将含有纤维素酶的细菌，例如假单孢菌、梭菌、类菌体等大量繁殖后，放入废水中，它们将靠自身释放的纤维素酶将水中的纤维素降解为一系列简单的小分子有机物，例如乳酸、醋酸、甲酸、乙醇以及短链化合物等，然后被继续降解或者靠甲烷菌作用，还原为H2，CO2和CH4.还有许多微生物含有硫酸盐酶，能将废水中的另一主要成份——有机硫酸盐降解为无机硫酸盐和相应的醇。微生物是出色的大自然清洁工，它的武器就是体内含有的形形色色的酶，只要遇到“可口”的垃圾，它便不要命地大口大口地吃，直到吃光为止。如果力量不够，它会自我繁殖，很快壮大自己的队伍。所以在与自然求和谐的时代，微生物是名符其实的“风云人物”。
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