秦可卿的死因成为读者和研究者热议的话题，秦可卿到底是死于病还是死于情？第十回首次提及秦可卿生病的事情，尤氏说：“他这些日子不知怎么着，经期有两个多月没来。叫大夫瞧了，又说并不是喜。那两日，到了下半天就懒得动，话也懒怠说，眼神也发眩。”尤氏说了秦可卿的病症，又分析了病因，是心情压抑、思虑过重导致的。冯子英推荐的大夫张友士也说，秦可卿心性高强，聪明过人，聪明忒过，则不如意事常有，不如意事常有，则思虑太过。据张友士说，秦可卿今年冬天是没有问题的，春分是她的关口，若过了，则有望痊愈。张友士的话音流露出，秦可卿的病情难以治愈。第十一回尤氏向王夫人诉说秦可卿得病的经过时说：“上月中秋还跟着老太太、太太们玩了半夜，回家来好好的。到了二十后，一日比一日觉懒，也懒待吃东西，这将近有半个多月了。”王熙凤第一次看望秦可卿是贾敬生日那天，从秦可卿得病到“如今才九月半”，不到一月时间，秦可卿对治病则失去了信心，她对王熙凤说：“任凭神仙也罢，治得病治不得命，婶子，我知道我这病不过是挨日子。”可见，秦可卿病情已严重到了什么程度。十二月初二，凤姐奉贾母之命又去看望秦可卿，秦可卿“虽未添病，但是那脸上身上的肉全瘦干了”。王熙凤对尤氏说：“这实在没法儿了。你也该将一应的后事用的东西给他料理料理，冲一冲也好”。言外之意，秦可卿已经快不行了。从秦可卿生病，到她去世，只有短短四五个月的时间，这期间没有任何大夫诊断明白秦可卿得的是什么病，这令人不可思议，贾府正在如日中天之际，太医院御医众多，医术高明者不乏其人，难道没有一人能够诊断其病症？这让读者产生了疑问。
曹雪芹在文本中说秦可卿是有病而死，但没有任何一个大夫能够明确诊断其病因，读者不能不对秦可卿的死因产生疑问，秦可卿不是死于病，应该是死于情。如果秦可卿真的死于情，那么，读者自然联想到第十三回回前脂砚斋“秦可卿淫丧天香楼”的批注：“‘秦可卿淫丧天香楼’，作者用史笔也。老朽因有魂托凤姐贾家后事二件，岂是安富尊荣坐享人能想得到者？其事虽未行，其言其意，令人悲切感服，姑赦之，因命芹溪删去‘遗簪’、‘更衣’诸文，是以此回只十页，删去天香楼一节，少去四五页也。”“注释1”根据脂砚斋的这段批注，读者有理由推想，秦可卿与公公贾珍性关系被发现羞愧而死是事实。秦可卿死后一系列表征，都显示出秦可卿与老公公贾珍有染的蛛丝马迹。
第一，秦可卿咽气的消息传出，全府上下一片震惊：“彼时合家皆知，无不纳罕，都有些疑心。”作者在这里设置了两个机关，一个是“纳罕”，一个是“疑心”。作者意在提醒读者，秦可卿真正的死因究竟是什么！通过家人的“震惊”、“纳罕”、“疑心”，写出了秦可卿的真正死因。如果秦可卿是由于生病而死，那么，家人必然知晓她生病的起因、病情的发展以及治疗过程，秦可卿由病到死是一个渐进的过程，其家人对这一过程是清楚的、熟知的，也就是说，家人对秦可卿的死是有心理准备的。在这种情景下，秦可卿死去，家人只会觉得惋惜——那长一辈的想他素日孝顺，平一辈的想他素日和睦亲密，下一辈的想他素日慈爱，以及家中仆从老小想他素日怜贫惜贱、慈老爱幼之恩，莫不悲号痛哭者，而不是“纳罕”、“疑心”。秦可卿只有突然逝去，家人猝不及防，毫无思想准备，才会“震惊”、“纳罕”，进而猜测她的死因，再由猜测到“疑心”。至此，秦可卿死于病的假象被完全“揭穿”！脂砚斋先生担心读者没有悟到雪芹先生预设的两个重要机关，又特意在此批注道：“九个字写尽天香楼事，是不写之写。”“注释2”曹雪芹先生用半遮半掩，掩而显露的方式，把秦可卿的死因清楚明了地写了出来，让人思索，令人玩味。
第二，贾珍哭得泪人一般是令人“纳罕”、“疑心”的另一证据。在古代伦理中，老公公与儿媳妇保持着相当的“距离”，不在同桌吃饭，不在同一场合起坐。可以说，儿媳妇与老公公几乎不见面、不说话，即使特殊场合见面、说话，也是恭恭敬敬问候，低头而匆忙离开。婆婆和丈夫是儿媳妇与老公公信息传递的唯一途径。按理说，秦可卿死了，最悲痛、最伤心的应该是丈夫贾蓉，其次是婆婆尤氏。秦可卿天天跟着婆婆尤氏，伺候尤氏，婆媳关系融洽，感情深厚。秦可卿突然逝去，丈夫贾蓉和婆婆尤氏悲伤哭泣，在情理之中。令人不解的是，秦可卿死了，不见丈夫贾蓉痛苦悲伤，更不见婆婆尤氏伤心哭泣，而唯有老公公贾珍哭天喊地，悲痛欲绝。令人可笑、可叹、可疑！脂砚斋在此批注道：“可笑！如丧考妣。此作者刺心笔也。”“注释3”儿媳妇死了，不见儿子伤心哭泣，也不见婆婆悲伤痛苦，唯见老公公撕心裂肺，比母亲死了还伤心，真是令人稀奇！这不能不令人联想到里面必有隐情。即使儿媳妇孝顺、能干，那么，婆婆对儿媳妇的感受是直接的，老公公对儿媳妇的感受是间接的，婆婆对儿媳妇的感情应该更深，其悲伤程度也应该更甚。从这一层面讲，应该更加凸显婆婆尤氏的悲伤、惋惜，而不是凸显老公公贾珍的伤心、难过。曹雪芹在此却做了相反的处理，秦可卿死后，《红楼梦》对丈夫贾蓉、婆婆尤氏的悲伤只字未提，对老公公贾珍哭天喊地、悲痛欲绝，如丧亲母的情状进行详尽刻画，以超出老公公与儿媳妇关系之常理，寓指贾珍与秦可卿之间特殊而微妙的公媳关系。
第三，“另设一坛于天香楼”是曹雪芹使用的“欲盖弥彰”手法。贾珍决定停灵七七四十九日，停灵时间长短，意味着对死者的尊重程度，四十九天是停灵时间最长的时限，这就意味着秦可卿享受最高规格的尊敬。贾珍同时决定，在四十九天的时间里，单请一百单八众禅僧在大厅上拜大悲忏，超度前亡后化诸魂，以免亡者之罪。贾珍在家里为秦可卿设灵堂，供亲友悼念，请禅僧做法事，超度亡灵。这些都是正常的，可以理解的，也是无可厚非的。然而，“另设一坛于天香楼，是九九位全真道士，打四十九日解冤洗业醮”，贾珍这一决定欲盖弥彰，让读者产生诸多联想：秦可卿与天香楼有何关系？为什么要设坛于天香楼，在此打醮解冤？这些问题困惑着读者，也令读者和研究者思考。脂砚斋先生也觉得这里与前面不太接榫，所以，在此批注道：“删——却是未删之笔。”“注释4”根据曹雪芹的原意，秦可卿与老公公贾珍有性关系，事情败露后，秦可卿“淫丧天香楼”。在这回中，曹雪芹写得较为详尽，但因秦可卿死后托梦于王熙凤，嘱咐她趁富贵之时，在祖茔附近多置田庄房舍地亩，将家塾迁至于此。按房掌管地亩、钱粮，供给祭祀、家塾费用，即便将来有了罪，家产可入官，这祭祀产业是不可入官的。就是败落下来，也有个退步，子孙可以回家读书务农，祭祀也可永继。脂砚斋看到秦可卿为贾府所虑有功，不忍心曹雪芹把秦可卿写成一个“堕落”之人，于是命雪芹删去了这一情节。但曹雪芹没有完全删除殆尽，还留有蛛丝马迹。没有删除殆尽的原因不外乎有二，一是曹雪芹本意要完全删除，但在修改时疏忽大意，没有删除干净；二是曹雪芹不愿完全删除，要留存一些秦可卿与贾珍关系暧昧的“根须”，让读者从这些蛛丝马迹中去思索、去想象、去玩味，达到“不写之写”的目的。读者读至“另设一坛于天香楼”时，自然会产生疑问：秦可卿死了，为什么要在“天香楼”另设一坛呢？秦可卿与天香楼有什么关系？有了这样的疑问，必然会思索、探寻，从而寻找到一些值得玩味的东西。
第四，秦可卿的丫环瑞珠，触柱身亡。瑞珠的死，如同秦可卿的死一样，是个谜，正如文本所说“此事可罕”。瑞珠为什么死？难道真是因为秦可卿死而伤痛吗？是不是还有不能言说或者不敢言说的原因？脂砚斋在“因忽又听得秦氏之丫环名唤瑞珠者，见秦氏死了，他也触柱而亡”后批注道：“补天香楼未删之文。”“注释5”其实，脂砚斋的这条批注是有问题的，问题出在“补”与“未删”之文上，既然是“补”，一定是补已经删去的文字，如果是未删之文字，又谈何“补”呢！因此，脂砚斋的这条批注应该是“补天香楼已删之文”。如果这样理解的话，在曹雪芹没有删改的原稿中，贾珍与秦可卿确有交欢之事，且被瑞珠无意间发觉。现在秦氏因此事而死，众人议评纷纷，直接影响到贾珍的脸面、自尊。贾珍内心恼羞成怒，必然暗查走漏消息之人，并必将对其置于死地。瑞珠惧怕贾珍，担心贾珍误认为是自己走漏了消息，从而殃及家人，遭杀身之祸，所以触柱身亡。这样，既能将秦氏与贾珍交欢之事永远封存，又挣得甘为秦氏陪葬的好名声。
第五，小丫环宝珠甘为义女，同样令人纳罕。虽然曹雪芹先生为宝珠作了必要的铺陈，说“因秦氏身无所出”，但明眼人一眼便可看穿，那是假象。真正的原因应该是，瑞珠和宝珠关系密切，瑞珠发觉贾珍和秦可卿交欢的事情后，她曾向宝珠透露过此事，宝珠也成为知情人之一。秦氏死后，瑞珠和宝珠十分恐慌，贾珍的阴影像磨盘一样压在她们心上，两人商量如何能摆脱贾珍的魔爪：瑞珠选择了陪葬，宝珠没有瑞珠的勇气，选择了甘当义女。但是，无论是瑞珠的殉葬，还是宝珠甘做义女，贾珍都无法再对其下手残害了。
第六，尤氏“装病”不理事，是对贾珍和秦可卿的报复。在发觉儿媳妇秦可卿和丈夫有偷情行为之前，尤氏对儿媳妇秦可卿的印象相当好，评价也很高。但是，自从尤氏发觉贾珍和秦可卿之间的“爬灰”行为后，尤氏对秦可卿的印象一落千丈，由原来的关心、呵护，变成了痛恨与不齿。正是尤氏对秦可卿前后态度和情感的巨大变化，让秦可卿感受到了难以承受的精神压力，最终选择了自缢的结局。秦可卿死后，贾珍悲痛欲绝，尤氏却认为秦可卿罪有应得。贾珍要厚葬秦可卿，尤氏却坚决反对。但强势霸道的贾珍无视尤氏的反对，一意孤行。尤氏不愿意自己像傻子一样，遮掩自己内心的“伤痛”，装出婆婆痛失好儿媳妇的表情，为与丈夫有性关系的儿媳妇的丧事忙前跑后，招待亲朋好友。但为了宁府的名誉，为了自己和丈夫的脸面，她又不得不忙前跑后，里外照应。为了摆脱两难的境地，尤氏巧妙地选择了“突发胃疼旧疾”，睡在床上。这是明写尤氏胃疼，实写尤氏心疼。尤氏“有病卧床”，就有了不理家的正当理由，对丈夫贾珍不惜超越礼法与规格，为秦可卿大办丧事的举止，可以眼不见，心不烦。自己静静躺在床上，对秦可卿的丧事不管不问，至少可以让自己已经流血的心不再遭受刺激。
第七，夫妻角色发生易位。整个第十三回，贾蓉的名字总共出现两次：一次是贾珍为其捐龙禁卫的职衔写履历出现过；一次是贾珍命其换上吉服去领龙禁卫的凭证。除此之外，没有贾蓉的任何言行，这不能不说奇怪。妻子死了，丈夫像局外人一样，既不悲伤，也不执事，甚至连影子都不出现，可见夫妻关系冷漠到何种程度。那么，夫妻关系冷漠的原因是什么？毫无疑问，跟父亲贾珍的插入有关。尤氏觉察到秦可卿与贾珍有不正当性行为，必然以各种形式提醒、暗示贾蓉，尤氏和贾蓉都是婚姻关系的受害者，二人有着相同的态度和感受，因此，他们必然形成“统一战线”，一致对外。但在那个“夫为妻纲”、“父为子纲”的社会背景下，尤氏和贾蓉无力对抗实力强大的贾珍，他们二人只能忍气吞声，仅仅担当名义上的“妻子”、“丈夫”角色。在夫妻关系中，公公置换了“丈夫”角色，儿媳置换了“妻子”角色，而真正夫妻关系已不复存在。这也就是秦可卿丧葬过程中，贾蓉、尤氏自始至终没有悲伤、哭泣的真正原因。
