武昌起义后，萨镇冰奉命率海军前往镇压，驻刘家庙及武汉、九江之间。10月17日，在海军炮火轰击下，革命军占领的武昌刘家庙车站失守。革命军政府都督黎元洪与萨镇冰有师生之谊。黎元洪致函其师萨镇冰以求得帮助。萨镇冰目睹清政府摇摇欲坠，各省纷纷独立的局面，既不愿为清廷殉葬，也不愿公然易帜加入革命军，对黎元洪回信说：“彼此心照，各尽其职。”后乃以有病需医为由离开舰队，搭乘英商太古公司轮船赴沪。11月11日，他以离舰出走向部下暗示对起义的默许，从而解除了各舰官兵的顾虑。第二天，由副官汤芗铭等以他的名义命令军舰退向九江，而汤芗铭等于中途反正，参加革命。
10月13日，汉口军政府成立，马骥云参加了军政府的领导工作。
10月22日清晨，陕西同盟会分会、哥老会与新军中的骨干人物在西安西门外林家坟的丛林中集会，最后决定了当天中午12时举行起义。张云山与马玉贵都出席了林家坟会议，后将这一消息传递给有关回族人士。上午10时许，陕西革命党打响了第一枪，宣告陕西起义爆发，由马文英召集的回族义军500多人，奔赴军装局领取弹械后来到回族聚居地维护社会秩序。当晚，张云山与马玉贵等人率领革命党攻占西安，宣布陕西独立，起义军组成临时司令部，定名为秦陇复汉军。23日，发布了起义活动的第一张文告：“各省皆变，排除满人，上征天意，下见人心。宗旨正大，第一保民，第二保商，三保外人，汉回人等，一视同仁。特此晓喻，其各放心。”在这张文告中，明确宣布了回汉同胞一视同仁的革命宗旨，这在当时很有历史意义。
王汝川倾其家资，与党人共议，在河北通州起义。联合滦军各同志，直捣北京，使清军首尾不能相顾。且他以家宅为党人活动总机关，密制旗帜、印信及购买枪械等物资，后因叛徒告密，被捕牺牲。
10月27日，在同盟会仰光总机关指导下，革命党人张文光（腾冲人）、马登云（腾冲人，回族）在云南腾越地区（即今云南省腾冲县）竖起义旗，向清朝宣战。腾冲回、汉、傣等各族同胞，与新军士兵一起击毙反动军官、76标3营管带张桐相，打死了反对起义的云南巡防第4营管带康福祥，逼迫清军腾越总兵张家钰吞金自杀，打响了云南辛亥革命的第一枪。起义宣告成功后，起义军以“九星旗”为旗帜，成立了云南最早的资产阶级革命政权——以张文光为都督的“滇西军政府”（后来无条件接受了以蔡锷为都督的云南政府领导），并将起义军扩编为20余营，先后开赴滇西各县，策动多起起义。在腾越起义中，同盟会会员、回族巨商罗汉彩参与其中，他的表现尤为突出。罗汉彩参加了独立军，应西回族青年也纷纷参加，在水平曲碉由于受罗汉彩的影响，千余回族青年参加了独立军的先遣队，曲铜教长马启华的长子马采廷参加并引导先遣队至蒙化（今巍山）大小围埂，又有大批回族青年参军并进攻蒙化县城。这时李根源（腾冲人，同盟会会员）、王廷治（昆明回族）西上大理督办滇西军务，对踊跃参加革命军的回族青年曾给予鼓励。黄兴赠给罗汉彩对联一副，以表彰他对革命的功勋：“适暹逻，辅中山，捐资备械，推翻帝制申大义；镇淘沙，防西陲，筹粮建军，拥护民主著奇勋。”落款是：“云五我兄正之，克强黄兴。”
10月29日，山西辛亥起义事举，太原广大回民积极响应，回民乔煦（留日学生，同盟会会员）时任陆军第2标第1营管带，及时地发放枪支子弹给清真寺附近的穆斯林和牛肉巷内的回民，以便参加战事，保卫革命成果。
10月30日，为响应武昌首义，云南革命党人在蔡锷、唐继尧、李烈钧等人的领导下，在昆明发动了著名的“重九起义”。回族将领马聪及回族同盟会会员陆锦先、孙永安、王廷治等人参加了这次起义。同盟会会员、清军19镇炮队军官陆锦先（广西百色回族）率部攻打督军署，云南讲武堂科长孙永安（回族）、王廷治（回族）等率步、炮、工各科学生，攻占省城小西门，占领西南城垣一带并担任警戒，马聪（昆明人，回族）与唐继尧受命围攻督署，他们为云南光复立下了战功。
11月1日，上海各业商团五六千人，在城内九亩地举行了总检阅，并设立了临时总指挥部。
11月2日，上海各商团负责人集会，决定准备武装起义，并商定第二天以钟鸣为号。总检阅完毕，各商团加紧部署。清真商团亦召开紧急会议，准备布防。当天夜里，商团成员集中住宿在清真商团营部所在地的福佑路清真寺，枕戈待命。
11月3日上午，闸北首先发动起义，上海清真商团率先到达指定地点，奋勇作战，留守防地的团员负责保卫城西北一带。后清真商团奉命去苏州阻截清廷军饷，还派部分团员为进军南京的革命军押运粮械，收缴紫金山残余清军的军械，并担任下关兵站的后勤工作，办理浦口至徐州间的军需运输等。清政府的官吏惊恐万状，仓皇逃入外国租界内。领导和指挥武装起义的陈其美，于午夜时分亲率敢死队和部分商团成员以及《民主报》记者赶到制造局，敦促总办投降，总办不允，并将陈其美等人扣留。敢死队成员见形势紧迫，遂立即向制造局发动进攻，守卫者负隅顽抗。清真商团得到消息后，立刻前往救援，前门攻打不开，遂越墙而入，放火烧房。制造局总办一见火起，惊慌失措，匆忙逃走。
11月4日黎明，在上海清真商团的帮助下，陈其美等人得以脱险，上海一夜之间光复。
上海光复后，随着军事形势的进展，清真商团的部分成员为进军南京的队伍押运粮械，向南京进发。抵达南京后，他们立即协同友军，收缴了在天宝城外紫金山麓残余清军的军械，在清真食品供应不及的情况下，以山芋充饥，克服困难，协同友军终于完成了任务。后来，又有30余名团员随军至浦口，奋战于浦口至徐州沿线，为革命立功，获“中华民国光复”奖章。
11月14日，宁夏革命同盟会支部在宁夏府城岳武庙（今银川市北门东侧）召开由各方负责人参加的紧急会议，会议推举刘先智为宁夏民军起义总指挥，高士秀为副总指挥。决定于次日晚上9时起义，攻击宁夏城，同时在中卫、平罗、灵武等地同时发起攻击，造成燎原之势。以哥老会和驻军巡防续补五营为主力，在宁夏府城举行武装起义，各地同时举事发难。但是，到了当日晚上，驻防清兵获得情报后，将起义军从宁夏府城打到了八里桥一带。高士秀、高登云等人见攻城困难，遂将部队撤到了灵武。
11月19日晚，高士秀、马四虎等率部攻入宁夏城垣，击毙了拒降的代理宁夏总长官贺明堂等大小官吏数百名。宁夏知县陈元骧弃城而逃，后被起义民军追至立岗堡杀死。宁夏革命同盟会支部的马四虎等发动起义，攻占了宁夏府城，光复了平罗。为了庆祝这来之不易的胜利，宁夏府城军民隆重集会，打开仓库，赈济贫民。一时间，革命党人赢得了全城百姓的拥戴，起义军很快发展到了3000多人，自称“灵州复汉军”，军旗为白色，上书红色“顺南”二字，以示响应南方的武昌起义。之后，成立军政府，公推高登云为大元帅，杨忠厚为参军。与此同时，军政府令高士秀带领人马，攻占了黄河渡口横城，收缴了清军全部武器马匹，收编了清军官兵，高士秀部顿时成为一支劲旅。
11月22日，重庆同盟会发动起义，温友松接通知后，荷枪实弹，与石青阳、卢汉臣等参加战斗的行列。辛亥革命成功后，商业资本在重庆已开始得到新的发展。温布松是以文人经商，加之他乐于助人，而且疏财仗义，颇负众望，被推为重庆公断处长，专为商会人员排难解纷。清朝驻有6营清军，其中半数为回回。在革命思想的影响下，回族士兵与其他官兵一起发动起义，宣布独立，为蜀军政府的成立建立了功勋。
11月23日，宁夏革命军政府在宁夏府城衙门成立，同时颁布了他们的《新政大纲》与《临时政纲》，积极安定民心，竭力恢复生产。虽然革命党人占据了宁夏府城，但是盘踞在满城的八旗驻防军2000多人，武器精良，粮秣充足，城防坚固，与宁夏革命党形成了对峙的态势。
12月2日起，革命党向满城的清兵发起攻击，双方鏖战十昼夜，革命党人无法突破其城防工事。革命党人的重要领导人刘先智在战斗中惨死清兵刃口，起义部队士气受挫。为了熄灭宁夏燃起的这场熊熊烈火，马安良派出自己的重要将领马麒前来镇压。
12月18日，马麒驰援满城清兵，率领精锐“西军”一部进攻宁夏府城。马麒的部队势不可挡，全线突破宁夏府城。精锐西军进城后，烧杀劫掠，市民死伤1400多人。随后，灵州、平罗也相继陷落。
12月上旬，河南同盟会预谋起义，组织了以同盟会会员王天杰、崔德聚、李鸿绪、刘风楼等人为主的敢死队，张钟瑞任命丹鹏晏为敢死队队长，原计划率敢死队青年壮丁500余人，在22日深夜12点攻打河南巡抚衙门。由于叛徒告密，丹鹏晏在12月22日前半夜就被清兵围困在自己家中，12月25日被押赴刑场，英勇就义，为革命事业献出了自己23岁的生命。
王丕谟带领铁血会通州成员赴滦州参加滦州起义，滦州起义失败，王丕谟幸免于难。后又积极谋划通州起义，之后还参与了天津起义的筹划。
就读于天津女师的刘清扬参加了天津共和会。共和会的主要任务就是发动滦州起义，然后进攻北京。刘清扬和共和会成员向群众散发革命传单，油印革命宣传品，有时她还通过关系探听军情，私下募集革命经费，积极投身滦州起义的准备工作当中。
武昌起义爆发后，汉口清廷地方散兵流盗乘机滋扰，秩序混乱。汉口各界各团体联合会总干事马刚侯，邀集各团体负责人集会，商讨维护地方治安和协助国民军事宜，清真自治公益会带头响应。该会负责维持汉江之滨地段社会治安、消防和支援民军工作。他们“外侦敌情，内缉奸宄，或时祝融肆威，极力灌救，或时战场缺食，踊跃输浆。屈指约二十余日，而地方得以安宁，人心得以鼓舞”。因该会为维护地方治安，支援民军做了大量工作，受到湖北军政府的嘉奖和社会各界的好评。该会还为发扬回族传统武术，资助发展回族教育，维护汉口民权路清真寺房地产的合法权益等作出了一定贡献。
年底，回民马万荣率哥老会忠义堂的成员首先响应革命党人刘先俊等人的号召，积极策动起义，指挥部就设在南关福寺巷回族磨商刘哈只（刘进才）的家，后由于奸人出卖，形势危急，提前起义，经过激烈战斗，刘先俊等人被捕牺牲。
1912年
1月1日，孙中山就任南京临时政府临时大总统，宣告中华民国成立。孙中山先生在就任临时大总统的宣言书中指出：“国家之本，在于人民，合汉、满、蒙、藏、回诸地为一国，则合汉、满、蒙、回、藏诸族为一人，是曰民族之统一。”
黄镇磐任上海地方检察厅检察官，为孙中山的法律顾问之一。廖仲恺任孙先生的机要秘书，黄兴的儿女亲家陈兴任上海地方检察厅检察长，当时政界传称“陈、廖、黄”为孙中山最为贴身的三个法律顾问。
1月7日深夜，伊犁爆发起义。革命党人推举杨瓒绪为总指挥，回族马凌霄等人率领步、骑、工各营民军及由哥老会会员组成的义勇团，在左胳膊上缠着白布，冲向慧远城。慧远城守军、回族人马德元打开东门，把马凌霄等人所率起义军迎进慧远城，随后马德元加入到回民马尕思率领的数百义军中，与清军作战，他们和马凌霄等人很快占领了军械库。民军得到武装，士气大振，起义军分兵三路，攻打将军署、军械北库和阻击敌人援军。在战斗最激烈时，曾参加迪化（今乌鲁木齐）起义的哥老会回族首领马万荣，率领100多名由回民组成的铁血敢死队员参战，回族知识分子韩玉书也召集回民数十人协助战事。很快，边疆伊犁革命宣告胜利。伊犁革命军成立新伊大都督府，并成立陆军第一师，回族马凌霄出任骑兵团长，曾率团至精河，参加了东征迪化的战斗。后来伊犁军政府被新疆都督杨增新分化瓦解，马凌霄也被杨增新逼走，丢掉了兵权，返回了内地。
3月6日，赵维熙、张林炎、马福祥代表甘肃通电承认共和。8日，张云山与马安良、彭英甲正式签订停战协定，马安良部撤军，表示拥立共和，随后撤兵返回甘肃。接着，彭英甲亦遵照袁世凯电令，通知陆洪涛及南路军张行志部撤军退回甘肃，升允在众叛亲离的狼狈处境中，只好于10日撤离礼泉，西路战事方告结束。
春，马麒公开“拥护共和”，被北洋政府任命为西宁镇总兵。马邻翼与弟子马松亭等人在北京的花寺清真寺，提出回族子弟应当“多读中外文，将来才能立大事业”的主张，指出要实现这一愿望，一是“由各寺阿訇掌教极力倡导”，二是“更宜稍加强迫”，并身体力行，续收马善亭、李廷相、赵铭周、朱开祺、张耀亭、王敬一等，共计18名弟子，亲授阿、汉两学。
春，乌鲁木齐回族受到同盟会会员刘先俊等人的影响，回民马万荣率哥老会忠义堂首先响应。乌鲁木齐起义之前，马万荣事前组织攻击部、防卫部、机要部，成立了起义领导机关，积极策动起义。后来，由于奸人告密，形势紧迫，刘先俊与回族马万荣等人在南关福寺巷回族磨商刘哈只（刘进才）家召开紧急会议，并将100多名参加起义的革命志士集中于刘家的水磨院内，于一天夜里发动起义。
南京光复后，30余名清真商团成员随军渡江浦口，驻扎在浦口清真寺内，担任北上队伍的军需运输任务，辗转奋战在浦口至徐州沿线，得到皖省都督杨文蔚的嘉奖。沪军都督陈其美给团员们颁发了“中华民国光复奖章”。
