轻松地拜访了盲目之龙后，魔力宝贝踏上了最后的征程。
雷克塔尔镇的居民知道这是魔力宝贝的最后一站，纷纷表示支持。村民乔尼尔把雨晴带到一口井前面，说：“听说这口井是与死亡之国相连的通道啊。一直认为这种话纯属编造，可是最近从井底真的传来一阵阵腥臭的气味。肯定是因为哪个家伙把脏东西都往井里扔的缘故吧。你有勇气下去调查前往诺斯菲拉特的道路么？”
魔力宝贝相互对望，鼓起勇气前往地下的冥府之道。里面黑暗幽深，真的仿佛是传说中的幽冥地界。卡米和爱尔卡拉乌丝公主手牵着手，十指紧扣。
出人意料的是，在这最后的关卡中，居然再一次看见了巫术师耶卡。他还是那副死亡之王的模样，凶狠地说：“这个时刻终于来临了。准备前往诺斯菲拉特斯的愚蠢的人啊，过来送死吧。
等一下，帝国兵，你为什么你现在还是4000年前的老样子，一点也没有改变。这难道是因为阿尔卡迪亚帝国魔法科学的缘故？那也不错。这样的话，就能亲自去为阿夏芙报仇雪恨！”
卡米连忙解释说：“耶卡叔叔，你误会了！我们是魔力宝贝，不是帝国兵啊！”
可是他已经被仇恨蒙蔽了眼睛了，说什么也不会善罢甘休，魔力宝贝只好极不情愿地开战。他比上次更强了，等级80，生命值10000，使用技能单恢、攻反、攻无、乾坤、诸刃、圣盾、混攻、强地、强火、召唤。左右的巫医助手看起来无比的忠心。
虽然不愿意与之为敌，可是为了尽快到达诺斯菲拉特，卡米只好挥剑相向。战胜了耶卡之后，通过冥府之道的出口，魔力宝贝进入了传说中的诺斯菲拉特。
这只是诺斯菲拉特的前沿，还是显得无比苍凉，亡灵遍地。进入黑之宫殿之后，雨晴看见了在此守候的歌姬赛莲，她显得很开心，说：“欢迎来到毁灭之国阿尔卡迪亚。杜瓦一直在期待着您的归来的这一天。请您立刻去晋见。然后请您一定要达成杜瓦的心愿。”
筱竹谢过歌姬赛莲，推开房门，终于看见了神秘无比的龙之沙漏。龙之沙漏一共有三个，晶莹无比，神秘异常，闪烁着永恒的光辉。失翼之龙杜瓦就在那里守护着。
杜瓦已经苍老得走不动了，当他看见魔力宝贝的到来之时，微笑着说：“继承着阿尔卡迪亚血统的人啊，你终于来了。我是最后的龙，杜瓦，一直等着您归来的这一天啊。在永无止境，周而复始的世界中，能从时间的牢狱里逃了出来的你是我们的希望啊。让我来详细地告诉你为什么这个世界会拥有无止境循环的历史。
放在那里的三个沙漏是罗连斯在阿尔卡迪亚帝国全盛时期所制造出来的东西。得益于李贝留斯神带来的知识，他获得了操控时间，穿梭时空的技术。虽然不能制作出永不消失的肉体，但是却完成了使魂魄归附肉体的技术。操控时间的沙漏，连结空间与空间的魔方阵，使魂魄重归肉体的还魂之玉，守卫帝国的结界装置……帝国的魔导装置没有一样不是精品。可是如果没有象女皇阿尔卡迪亚那样强大的魔力，那些危险的道具根本没什么用。阿尔卡迪亚被暗杀之后，守卫帝国的结界变弱了。勇者里雍他们在你的帮助下成功打破了结界。阿尔卡迪亚在与艾尔巴尼亚王国的决战中败北，女王便使用魔方阵逃往了异世界。然而由于女王的力量不足，魔方阵开始暴走，从破裂的空间中释放出超强的能量，给库鲁克斯岛造成了极大的灾难。如果放任不管的话，这个空间将会不断扩展开来，最后可能湮没整个世界。因此我们三条龙使用了能操控时间的沙漏，使魔方阵周围的时间停了下来。沙子每掉下一粒，沙漏就能再现沙粒中的记忆。然后沙漏再让在时间循环中绝望的人们的魂魄重归于沙粒之中。沙粒的记忆就这样无止境的反复着。是我们把这个世界封闭在时间的牢狱之中。在这个世界里只有过去而根本没有未来。
希望之子啊。由于您逃往了异世界，所以没有被囚困于时间之中。召唤士盖兹把您从异世界召唤回来，所以您就在与现实不同的时间里出现了。和里雍并肩作战，奋力抵抗艾尔阿迪亚帝国的无疑就是您啊。无数次您从这个世界诞生，然后逃往异世界，最后又返回到原来的世界来。然而有一天我们终于能够相见了。把我们……把这个世界从时间的牢狱中解放出去吧。希望您把我们三条龙打倒，然后把沙漏破坏掉。希望您去解放这个时空，还世界一个本来的面貌。我相信您一定有能力去制止操控空间的魔方阵的运行。拜托您了……我们已经很累了。”
魔力宝贝终于明白了一切，明白了神椎之战，明白了龙之沙漏，明白了魔力宝贝，明白了异世界，明白了四千年的轮回。
一切都明白了！可是这真相，竟然是如此的残酷。魔力宝贝本是帝国的子孙，却被召唤来对付帝国的李贝留斯神和阿尔卡迪亚女王。魔力宝贝拯救了世界，却其实只不过是回归了过去罢了。
最可悲的是，要打破沙漏，解放时间，拯救世界，就必须要杀死三头老龙，三头数千年来一直守卫着龙之沙漏的老龙，三头为了维护世界和平的老龙。
“不！杜瓦爷爷，我不要你死！我不要和你战斗！”爱尔克拉乌丝公主绝望地哭着。
杜瓦显得很平静，安宁地笑着说：“孩子！你的善良我很感动，可是这是拯救世界的唯一方法。自从我启动时间沙漏的那一天，我就预料到了一起。只是想不到这一天来得如此之迟。我等着一天已经很久了，你们只有击败我们，才可以还世界原来的面目。而我们也可以得到解脱了。”
雨晴和筱竹泣不成声，茜茜更是哭得成了泪人。卡米心神疲惫，痛苦得摇摇欲坠。
“孩子们！勇敢一点，攻过来吧！我们不会怪你们的。牺牲我们三个，换来世界的未来，这是多么幸福的事情啊！而我们也可以完成使命了，你们不是应该替我们高兴么？开始吧！魔力宝贝，我的兄弟诺利和艾汀已经传送过来了！动手吧！”
战斗无情地开始了！三头老龙神情自若地面对着“敌人”，他们谈笑风生，毫不抵抗，苍老的脸上满是潇洒，满是智慧。卡米和雨晴心内滴血，绝望地战胜了自己这一辈子最不愿意战胜的“敌人”！三头龙的仁义让人敬佩。
“去拯救你们的世界吧！永别了，异世界的魔力宝贝！－谢谢您！这样的话大家都……得救了……世界的历史将再一次……向着无人能预知的未来……一直行进下去……”
几千年之后，雨晴清楚地记得，当他们倒下的时候，脸上挂着安宁的微笑，他们没有一点伤心，没有一点痛苦。世界在这一瞬间恢复了平静，时间恢复了正常。
沙漏打破了，仿佛是玻璃破碎一样，清脆的声音震撼着每一个人的心……
“诺利爷爷！艾汀爷爷！杜瓦爷爷！”爱尔克拉乌丝公主绝望痛哭。
卡米想要安慰她几句，却哽咽得说不出话来，是啊！这个时候，谁能不伤心绝望呢？
雨晴搀扶着爱尔克拉乌丝公主轻轻地走出了黑之宫殿，传送到魔法方阵前面。出乎意料的是军神李贝留斯就在眼前。
“啊！李贝留斯，你不是被卡莲女神关在六曜之塔么？”卡米惊讶道。
李贝留斯轻叹一口气，看着已经破碎的沙漏说：“开启者啊！拥有着我血统的人啊。既然拥有了能打倒我的力量，难道还不能够控制这个魔导装置吗？虽然隐藏在你身体里的神力无穷无尽，可是住在人域的你却不能完全发挥出来。只是不稳定的力量……但是，这样做能够改变整个世界的命运。如今我必须给你们一些帮助……我把我剩下的力量全部给你。我能帮你的也就这一次了。今后你必须要学会用自己的力量来控制魔导装置啊。我是李贝留斯……存在就是为了复仇的神，李贝留斯……可……此刻我在此突然的出现……是为了你……更是为了阿尔卡迪亚……”
“阿尔卡迪亚？难道这就是阿尔卡迪亚？”雨晴看着沙漏的碎片前的女孩。
但是她显然不是阿尔卡迪亚，女王早已在神椎之战中消陨了！魔力宝贝眼前看到的，只是梅塞库特的灵魂。她看起来有些憔悴，但精神还是挺好，仿佛大病初愈的样子。梅塞库特公主微笑着说：“感谢你帮我打破了沙漏。我是赛库梅特公主的灵魂……我的肉体在很久以前就已经消失了。
现在和你说话的，是我的记忆。你好不容易打破了沙漏并拯救了世界，和你说这种话实在是抱歉啊。但是我想把你传送到未来。我们要把反复经历了无数次毁灭的未来……我的母亲，不，应该因暗杀而亡的女皇阿尔卡迪亚其实并没有消失。在阿尔卡迪亚帝国的子孙中，她不断夺取拥有强大力量的人的肉体，作为新的阿尔卡迪亚女王而复活。阿尔卡迪亚用神秘的宝物使自己得到永生，可是她的内心却对毁灭她的人们充满了憎恨和仇视。旧的肉体死亡，她的灵魂就不断寻找新的肉体作为依附，杀戮就这样持续着。长此以往，反反复复，阿尔卡迪亚内心的仇恨日益膨胀。我现在已经完全记不得她是如何侵占别人肉体的。她侵占拥有强大力量的子孙们的肉体，而最终毁灭了整个世界。在世界化为灰烬之后，沙漏依靠着沙粒的记忆又重新创造了一个原样的世界。和被毁灭的那个一模一样的世界就这样被……沙漏把人的性命变成一粒粒沙。每增加一粒沙，历史就重新再来一次。随着沙漏的毁坏，沙粒也不再增加。反反复复的历史终于结束了。但是……我坚信未来将会改变。你在这里的出现就是历史正在改变的最好证明。解放世界的人啊。我准备把你的名字铭记在沙粒中。这样即使我不复存在了，我也能永远永远……记得你的名字……谢谢你了。那么就……请回去吧。你一定经历了非常辛苦的旅程吧……你能回到这个世界来……我真的很高兴。
等你有实力完全操控魔方阵的时候，你就可以……返回到……养育你的异世界去了……啊……谢谢……你了……请你回去……吧……谢……谢……你……了……”
李贝留斯和梅塞库特的灵魂飘走了。一切都结束了。
历史，开始了新的篇章。
尽管还有许许多多的疑问，但是魔力宝贝终于完成了最艰难的使命。
多年的愿望终于实现了，卡米牵着爱尔克拉乌丝公主的说，心里默默地说：“霜芷，我们成功了！你看得到么？你也会和我一样开心么？”
魔力宝贝带着沙漏的碎片和永久的称号“解放者”，离开了诺斯菲拉特……
一切都结束了。一切又才刚刚开始。
龙之沙漏时代宣告过去，乐园之卵开始了新的篇章……
