将太甲流放之后，伊尹自立为王，有莘氏大权得享。在桐宫的日子不好过，太甲更是切身感受到了无尽的屈辱，陪伴着祖父的陵寝，太甲在心底坚定了一个信念：祖先创造的荣誉不能因我而蒙羞，商氏的基业也不能毁在我的手里。在桐宫流放的光阴，太甲并没有虚度，他仔细地分析了商氏所处的窘境，谋划着商氏以及自己的出路。在桐宫流放的岁月，太甲也并不孤单，被伊尹以权力打压的商氏，会不失时机地派人来到太甲这里，一起谋划一些事情。
在被流放的三年之期，太甲终于找到了一个机会。这个机会太甲把握的很好，也取得了初步的成功，但是还远没有达到翻盘的目的。太甲只得带着忠于自己的族人出走，死后葬在了历山，这个地方离商的亳都很远。太甲死后，他的儿子沃丁继位，追谥太甲为太宗。沃丁即位之后，任用了一个叫保衡的人为相。沃丁死后，他的弟弟太庚继位；太庚死后，他的儿子小甲继位；小甲死后，他的弟弟雍已继位。这一时期，商氏执掌天下的政权并不稳固，或许政治本身就不是商氏所擅长的吧。虽然在政治上没有起色，商氏的手工业和商业却得到了更好的发展，贸易很是繁忙，经济很是繁荣。
雍已死了之后，他的弟弟太戊继位，这就是太戊帝。在太戊帝的时候，重新采取了与伊氏、有莘氏合作的政策，商氏在政治上有了很大起色。尹的封地在伊，尹以封地为姓，于是尹的大号全称就叫伊尹。尹的后人也都以封地伊为姓，太戊帝即位后，任用伊尹的后人伊陟为相。商氏敬神信鬼，遇事总要祭问上天，即便是出现一些稀奇古怪的事，商氏也会当成大事来看。比如太戊帝的时候，帝都出现了桑树和楮树合生在一起的怪异现象，太戊帝就很担心，于是找来伊陟商量。伊陟也没办法解释这一怪异的自然现象啊，于是就找来了巫贤。巫贤是当时很有名望的一个人，同时也是一个著名的大巫。在巫贤做了一通法术，祭问上天之后，这件事就不了了之了。在太戊帝与伊陟的共同努力下，商氏的政权再度兴盛，好多年不来进贡的氏族，又都带着贡赋来到亳都表示归服。太戊帝死后，他的儿子中丁继位，追谥太戊帝为中宗。
中丁帝死后，他的弟弟外壬夺取了帝位，开启了商氏的九世之乱模式。前面我们分析过，在商氏取得政权政权的过程中，有两个人和一个氏族发挥了非常积极的作用。这两个人分别是伊尹和仲虺，这一个氏族就是有莘氏，后来，伊尹被封在了伊，仲虺被封在了邳，有莘氏也迁到了姺。在外壬夺取了商氏的权力之后，迁到了姺的有莘氏，还有被封在了邳的仲虺的后人，都发出了不同的声音。商氏的政权陷入战乱，曾经的联盟开始决裂。
外壬帝死后，他的弟弟河亶甲继位。河亶甲帝的时候，战乱的规模扩大，河亶甲帝把商都从隞迁到了相，并在战乱之中结成了两个新盟友。这两个新盟友的实力很强大，他们分别是大彭和豕韦。在大彭的帮助下，邳归顺了河亶甲帝，姺也被孤立起来，最终向河亶甲帝归服。河亶甲帝联合起大彭与豕韦的力量，与东南方的兰夷、班方作战。
河亶甲帝死后，他的儿子祖乙继位。祖乙帝即位后，又开始迁都，先是从相迁到了耿，后来又从耿迁到了庇，并且把他的弟弟封在了耿。在大彭与豕韦两个氏族的帮助下，祖乙帝征服了东南方的兰夷和班方。祖乙帝在位期间，巫咸被任以重职，商氏的政权又兴盛起来。看到这儿，或许有人会不屑：一个大巫而已，怎么能给商氏带来兴盛？我们或许对巫的理解有些片面了，除了祭祀鬼神这种活动，我们现在可以说它不科学之外，其实换个角度来说，巫掌握着当时最丰富的知识，同时也代表了当时先进的文化的。另外，在商朝那个时期，巫教的影响力极其广泛，势力也是非常大的。祖乙帝重用巫咸，似乎代表着在祖乙帝时期，在商氏的政权与巫教的教义之间，实现了相互妥协和有机融合。
祖乙帝死后，他的儿子祖辛继位；祖辛帝死后，他的弟弟沃甲继位；沃甲帝死后，祖辛的儿子祖丁继位；祖丁帝死后，沃甲的儿子南庚继位；南庚帝死后，他的儿子阳甲继位。南庚帝在位的时候，又将商都从庇迁到了奄。阳甲帝在位的时候，因为多年帝位的争夺，奴隶主集团的势力盘根错节，商氏的内部已经相当混乱。
从中丁帝到阳甲帝，史称“九世之乱”。这一时期的商氏，主要表现出三个特点。第一个特点是帝位继承制度的不确定。反观前面的文字，我们不难发现，这一时期商氏的帝位继承，有儿子继承父亲的，有弟弟继承哥哥的，有侄子继承叔叔的，还有堂弟继承堂兄的，章法不是一般的混乱。正是这种帝位继承制度上的不确定，商氏陷入了争权的混乱之中，这种混乱，给商氏带来了政治上的衰败。到阳甲帝的时候，很多诸侯已经不给商氏上贡了。第二个特点是频繁迁都。比如中丁帝迁都于隞，河亶甲帝迁都于相，祖乙帝先后迁都至耿、邢以及庇，南庚帝又迁都到了奄。第三个特点是频繁的迁都导致商氏族人的离心。迁都是一个很繁琐的事情，有很多系统性的工作要去做，频繁的迁都给人民带来了疲乏。同时，对于每一次迁都，在商氏内部总会有一些不同的声音出现，随着频繁的迁都，这些不同的声音就会越来越多。排除因为自然灾害而迁都的情况，商氏曾经迁徙过的那些旧都城，总会留下不少的商氏族人，这样，商氏新都的人口就会越来越少，而人口上的减少也间接导致了商氏的衰败。
