不知道为什么，只不过是和小五郎、小兰一起去了趟月影岛，回来以后就有些变了。破案的时候不像以往那般对犯人步步紧逼，就连解决了偶有发生的MOON的审判后，也不再像以往一样逼问犯人探查MOON的情报，而仅仅是劝告或开解。[注1]
看出了柯南的异常，阿笠博士推荐他去伊豆放松一下，而且三日两夜的住宿可是免费的。
不过，房租竟然只付了一半！这不禁让柯南想起了博士在免费前面加的前提：“你到的话就等于免费。”
“我和一个学者朋友和他的孙女参加了一个‘伊豆神秘旅游团’，可他的孙女病了，只好让给你们了。参加的人数总共有七组十二人[注2]住宿费是半价，条件是找到扮演‘暗夜男爵’的主办者，而且还可以得到一张输入了一个方程式的磁碟。”
以上就是博士的告诉柯南的信息了。
暗夜男爵，是柯南的父亲工藤优作笔下的只在黑夜出没的怪盗，有时更是冷酷的杀人魔，现在的身份还未被作者公布。
最终目的就是在十二人中找到假扮暗夜男爵的主办者，所以柯南开始调查参加者的信息。
柯南、毛利和小兰；
银行职员今野史郎；
电脑程序设计师江原时男；
电脑公司老板金城玄一郎和他的管家林静江；
电脑软件公司老板上条秀子；
六年前全日本空手道冠军前田聪，他也是小兰学空手道的原因；
前田聪的未婚妻，高校数学老师佐山明子；
咖啡店服务员灰原爱，不知道为何，明明是没见过的脸，但就是感觉有些熟悉；
还有——
“七月！怎么是你？”柯南看到坐在明美身旁沙发扶手上的孩童，惊讶地喊道。
“哦，柯南啊。我当然是有我的需求啦，不过好像参加者没有你吧？”七月放下了手上的相册，柯南注意到，是前田聪六年前的比赛照片。
“（已经开始调查这些人的信息了吗？看来七月是志在必得。不过以他的性格来看应该不会是单纯的为了省钱或是解谜，恐怕是为了那张磁碟吧？不知道是什么里面是什么竟然能让他这么认真。）”柯南心里想着，顺口答道：“博士和他的朋友有事没来。这位是……”
“我和小爱的监护人，灰原爱。你应该见过吧？就在毛利侦探事务所楼下的波洛咖啡厅打工呀。”
夜。
柯南站在阳台上思考着，他的侦探直觉告诉他那张磁碟不简单，正准备给博士打电话询问，却被突然出现在面前的暗夜男爵从阳台上推了下去。幸好下面是泳池。
柯南更加疑惑，虽然除去他们三人和七月以外还有八个人可能是暗夜男爵，但这不过是一个免费住宿的游戏，为什么会因为这个而从阳台上往下推人？而且，为什么连七月会跑来这里？博士的话又为何那么奇怪？柯南决定向博士询问清楚，可是博士刚说出了“病毒”就被小兰的出现打断了，柯南慌忙地挂掉了电话。
趁着吃饭时间，柯南又跑到了七月身边准备问问病毒的事。
“诶？你不知道？原来你只是来放松的啊。”七月感到很无语，你说随便放松一下都能恰巧跑到这个团里，说你不是死神代言人谁信啊？不过七月还是做出了解释：“‘暗夜男爵’，就是这个病毒的名字。曾经侵入各大企业电脑摧毁资料，目前没有人成功捕获，自然也没有阻止的方法。”而小爱对这个病毒很感兴趣，所以我就跑来看看能不能得到。
“对了……”柯南刚想说点什么，却被突然出现拉住他的手打断了，扭头一看，原来是小兰。
“柯南，不要到处乱跑啦！”说着，向七月道了声歉，便拉着柯南离开了，看样子是要去休息了吧？看着柯南离开，七月也准备去朝获得病毒努力了。
当然，七月不知道，接下来柯南这个醋坛子又要为了阻止前田聪和毛利兰的貌似约会的行为而跑到瞭望台上去，然后又凭借着自己的死神体制引起了新的事件。
“啊，终于要回去了。”给小兰当了很久的小保镖，而且还被前田聪发现了的柯南同学一边走一边思考，“最后的问题也没问出来啊，活动的主办人究竟在想什么呢？为什么要举办这个活动？诶？”露天餐厅的骚动吸引了柯南的注意力，怀疑死者就是“暗夜男爵”的柯南立刻冲了进去，果不其然，而暗夜男爵的真实身份就是江原时男。负责这场案件的也是柯南的熟人，崇拜毛利小五郎的横沟警官。
“柯南，你是死神吗？”闻讯而来的七月忍不住对着柯南开始吐槽，“你给我有点自觉好不好，你怎么走到哪人死到哪啊？【小声】没变小的时候不也是这样么。”
听着七月的话，柯南想了想自己的经历，也对自己的体质产生了疑惑，不过嘴上还是说着“这是案件在呼唤我”之类的话。
“对了柯南，你来的比我早，调查到什么了吗？”调笑完了，也该说正事了，七月的表情变得严肃。
“应该是他杀，他的领带和皮带都打反了。”
“反……反了？”七月的脸有些抽搐，偏向于完美犯罪的他实在不能忍受这么简单的纰漏。
“嗯，接下来我准备跟着叔叔去死者房间看看，你呢？”
“我准备在现场调查一下，再怎么说别人的转述都只是转述而已，有新情报电话联系。”
到达21楼的柯南与警察们破坏了防盗链成功进入房间，并且发现了房间内的钥匙和阳台上的一只手套，在注意到正下方恰好是死者的位置后，毛利做出了“死者企图从阳台反到别人屋里却不小心失足”的推理后，却遭到了柯南的反驳，两人争论之际柯南的笔掉了出去，飞下了阳台。
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[注1]月影岛的案子大家应该都很印象深刻，就不再重复了，剧情没有变化。本来我考虑过救下诚实的，不过想了想这个案子的特殊地位，还是放弃了。虽然这个案子不是主线，但在我心中，这个案子才是柯南作为一个侦探走向成熟的真正开始。在柯南还是新一的时候，他曾经说过：“将犯人追到穷途末路的那种刺激，只要做过一次侦探就没法停止了。”而之后就不一样了。例如在外交官杀人事件里说的：“推理没有胜负因为真相只有一个。”还有名门连续惨死事件里说的：“我们侦探把凶手逼到尽头，如果最后就让他们自我了结的话，那和杀人犯有什么不一样？”能够发现柯南已经渐渐走向成熟，而不是一开始那个有些滑稽和毛躁的小侦探。
