1999年,黑神对人类彻底失去了信心,欲创造全新物种取代人类。老一辈的骑士们拼死抵抗,却无法阻拦心意已决的黑神。在这危机时刻,老魔王穿越时空以生命为代价封印黑神,并将命运的托付传送到20年后。黑神遗留下的新物种,也纷纷隐藏于人类社会,成立势力,伺机等待着各自的机会。这般相安无事了20年,直到2019年的最后一天,黑神封印的枷锁松动,各方的势力在京都这座城市的土地上再次上演各自的剧情,熟悉的英雄们因为世界线的变化,这一次将相聚在了同一舞台上。一位被遗忘的少年,将在这座城市遇上一位位英雄,走向他命中的道路。而年幼的小魔王,这一次等待他的,或许不再是至仁至善的道路。